Protein–RNA interactions for Protein: Q8N474

SFRP1, Secreted frizzled-related protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFRP1Q8N474 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SFRP1Q8N474 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SFRP1Q8N474 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SFRP1Q8N474 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SFRP1Q8N474 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SFRP1Q8N474 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SFRP1Q8N474 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SFRP1Q8N474 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SFRP1Q8N474 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SFRP1Q8N474 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SFRP1Q8N474 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SFRP1Q8N474 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SFRP1Q8N474 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SFRP1Q8N474 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SFRP1Q8N474 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SFRP1Q8N474 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SFRP1Q8N474 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SFRP1Q8N474 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SFRP1Q8N474 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SFRP1Q8N474 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SFRP1Q8N474 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SFRP1Q8N474 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SFRP1Q8N474 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SFRP1Q8N474 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SFRP1Q8N474 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SFRP1Q8N474 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SFRP1Q8N474 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SFRP1Q8N474 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SFRP1Q8N474 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SFRP1Q8N474 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SFRP1Q8N474 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
SFRP1Q8N474 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SFRP1Q8N474 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SFRP1Q8N474 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SFRP1Q8N474 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SFRP1Q8N474 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SFRP1Q8N474 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
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SFRP1Q8N474 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SFRP1Q8N474 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SFRP1Q8N474 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SFRP1Q8N474 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
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SFRP1Q8N474 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SFRP1Q8N474 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
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SFRP1Q8N474 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SFRP1Q8N474 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
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SFRP1Q8N474 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
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SFRP1Q8N474 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
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SFRP1Q8N474 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SFRP1Q8N474 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SFRP1Q8N474 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
SFRP1Q8N474 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
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SFRP1Q8N474 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SFRP1Q8N474 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
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SFRP1Q8N474 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
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SFRP1Q8N474 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
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SFRP1Q8N474 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SFRP1Q8N474 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SFRP1Q8N474 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SFRP1Q8N474 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SFRP1Q8N474 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SFRP1Q8N474 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SFRP1Q8N474 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SFRP1Q8N474 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SFRP1Q8N474 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SFRP1Q8N474 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SFRP1Q8N474 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SFRP1Q8N474 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SFRP1Q8N474 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
SFRP1Q8N474 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SFRP1Q8N474 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SFRP1Q8N474 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SFRP1Q8N474 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SFRP1Q8N474 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SFRP1Q8N474 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SFRP1Q8N474 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SFRP1Q8N474 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SFRP1Q8N474 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
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