Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3S7

CACNA2D4, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA2D4Q7Z3S7 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CACNA2D4Q7Z3S7 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CACNA2D4Q7Z3S7 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CACNA2D4Q7Z3S7 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CACNA2D4Q7Z3S7 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CACNA2D4Q7Z3S7 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CACNA2D4Q7Z3S7 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CACNA2D4Q7Z3S7 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CACNA2D4Q7Z3S7 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CACNA2D4Q7Z3S7 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CACNA2D4Q7Z3S7 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CACNA2D4Q7Z3S7 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CACNA2D4Q7Z3S7 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CACNA2D4Q7Z3S7 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CACNA2D4Q7Z3S7 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CACNA2D4Q7Z3S7 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CACNA2D4Q7Z3S7 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CACNA2D4Q7Z3S7 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CACNA2D4Q7Z3S7 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CACNA2D4Q7Z3S7 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CACNA2D4Q7Z3S7 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CACNA2D4Q7Z3S7 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CACNA2D4Q7Z3S7 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CACNA2D4Q7Z3S7 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CACNA2D4Q7Z3S7 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CACNA2D4Q7Z3S7 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CACNA2D4Q7Z3S7 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CACNA2D4Q7Z3S7 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CACNA2D4Q7Z3S7 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CACNA2D4Q7Z3S7 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CACNA2D4Q7Z3S7 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CACNA2D4Q7Z3S7 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CACNA2D4Q7Z3S7 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CACNA2D4Q7Z3S7 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CACNA2D4Q7Z3S7 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CACNA2D4Q7Z3S7 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CACNA2D4Q7Z3S7 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CACNA2D4Q7Z3S7 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CACNA2D4Q7Z3S7 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CACNA2D4Q7Z3S7 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CACNA2D4Q7Z3S7 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CACNA2D4Q7Z3S7 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CACNA2D4Q7Z3S7 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CACNA2D4Q7Z3S7 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CACNA2D4Q7Z3S7 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CACNA2D4Q7Z3S7 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CACNA2D4Q7Z3S7 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CACNA2D4Q7Z3S7 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CACNA2D4Q7Z3S7 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CACNA2D4Q7Z3S7 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CACNA2D4Q7Z3S7 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CACNA2D4Q7Z3S7 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CACNA2D4Q7Z3S7 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CACNA2D4Q7Z3S7 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CACNA2D4Q7Z3S7 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CACNA2D4Q7Z3S7 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CACNA2D4Q7Z3S7 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CACNA2D4Q7Z3S7 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CACNA2D4Q7Z3S7 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CACNA2D4Q7Z3S7 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CACNA2D4Q7Z3S7 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CACNA2D4Q7Z3S7 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CACNA2D4Q7Z3S7 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CACNA2D4Q7Z3S7 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CACNA2D4Q7Z3S7 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CACNA2D4Q7Z3S7 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CACNA2D4Q7Z3S7 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CACNA2D4Q7Z3S7 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CACNA2D4Q7Z3S7 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CACNA2D4Q7Z3S7 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CACNA2D4Q7Z3S7 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CACNA2D4Q7Z3S7 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CACNA2D4Q7Z3S7 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CACNA2D4Q7Z3S7 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CACNA2D4Q7Z3S7 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CACNA2D4Q7Z3S7 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CACNA2D4Q7Z3S7 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CACNA2D4Q7Z3S7 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CACNA2D4Q7Z3S7 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CACNA2D4Q7Z3S7 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CACNA2D4Q7Z3S7 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CACNA2D4Q7Z3S7 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CACNA2D4Q7Z3S7 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CACNA2D4Q7Z3S7 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CACNA2D4Q7Z3S7 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CACNA2D4Q7Z3S7 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CACNA2D4Q7Z3S7 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CACNA2D4Q7Z3S7 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CACNA2D4Q7Z3S7 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CACNA2D4Q7Z3S7 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CACNA2D4Q7Z3S7 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CACNA2D4Q7Z3S7 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CACNA2D4Q7Z3S7 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CACNA2D4Q7Z3S7 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CACNA2D4Q7Z3S7 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CACNA2D4Q7Z3S7 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CACNA2D4Q7Z3S7 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CACNA2D4Q7Z3S7 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CACNA2D4Q7Z3S7 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CACNA2D4Q7Z3S7 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms