Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3Q1

SLC46A3, Solute carrier family 46 member 3, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC46A3Q7Z3Q1 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SLC46A3Q7Z3Q1 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SLC46A3Q7Z3Q1 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SLC46A3Q7Z3Q1 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SLC46A3Q7Z3Q1 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SLC46A3Q7Z3Q1 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SLC46A3Q7Z3Q1 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SLC46A3Q7Z3Q1 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SLC46A3Q7Z3Q1 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SLC46A3Q7Z3Q1 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SLC46A3Q7Z3Q1 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SLC46A3Q7Z3Q1 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SLC46A3Q7Z3Q1 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SLC46A3Q7Z3Q1 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SLC46A3Q7Z3Q1 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SLC46A3Q7Z3Q1 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SLC46A3Q7Z3Q1 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SLC46A3Q7Z3Q1 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SLC46A3Q7Z3Q1 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SLC46A3Q7Z3Q1 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SLC46A3Q7Z3Q1 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SLC46A3Q7Z3Q1 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
SLC46A3Q7Z3Q1 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SLC46A3Q7Z3Q1 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SLC46A3Q7Z3Q1 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SLC46A3Q7Z3Q1 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
SLC46A3Q7Z3Q1 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SLC46A3Q7Z3Q1 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
SLC46A3Q7Z3Q1 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SLC46A3Q7Z3Q1 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SLC46A3Q7Z3Q1 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
SLC46A3Q7Z3Q1 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SLC46A3Q7Z3Q1 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SLC46A3Q7Z3Q1 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SLC46A3Q7Z3Q1 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SLC46A3Q7Z3Q1 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SLC46A3Q7Z3Q1 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SLC46A3Q7Z3Q1 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SLC46A3Q7Z3Q1 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SLC46A3Q7Z3Q1 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SLC46A3Q7Z3Q1 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SLC46A3Q7Z3Q1 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SLC46A3Q7Z3Q1 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SLC46A3Q7Z3Q1 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SLC46A3Q7Z3Q1 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SLC46A3Q7Z3Q1 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SLC46A3Q7Z3Q1 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SLC46A3Q7Z3Q1 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SLC46A3Q7Z3Q1 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SLC46A3Q7Z3Q1 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SLC46A3Q7Z3Q1 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SLC46A3Q7Z3Q1 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SLC46A3Q7Z3Q1 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SLC46A3Q7Z3Q1 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SLC46A3Q7Z3Q1 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SLC46A3Q7Z3Q1 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SLC46A3Q7Z3Q1 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SLC46A3Q7Z3Q1 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SLC46A3Q7Z3Q1 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SLC46A3Q7Z3Q1 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SLC46A3Q7Z3Q1 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SLC46A3Q7Z3Q1 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SLC46A3Q7Z3Q1 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SLC46A3Q7Z3Q1 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SLC46A3Q7Z3Q1 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SLC46A3Q7Z3Q1 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SLC46A3Q7Z3Q1 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SLC46A3Q7Z3Q1 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SLC46A3Q7Z3Q1 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SLC46A3Q7Z3Q1 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SLC46A3Q7Z3Q1 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SLC46A3Q7Z3Q1 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SLC46A3Q7Z3Q1 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SLC46A3Q7Z3Q1 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SLC46A3Q7Z3Q1 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SLC46A3Q7Z3Q1 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SLC46A3Q7Z3Q1 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SLC46A3Q7Z3Q1 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SLC46A3Q7Z3Q1 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SLC46A3Q7Z3Q1 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
SLC46A3Q7Z3Q1 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SLC46A3Q7Z3Q1 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
SLC46A3Q7Z3Q1 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SLC46A3Q7Z3Q1 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SLC46A3Q7Z3Q1 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SLC46A3Q7Z3Q1 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SLC46A3Q7Z3Q1 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SLC46A3Q7Z3Q1 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SLC46A3Q7Z3Q1 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SLC46A3Q7Z3Q1 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SLC46A3Q7Z3Q1 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SLC46A3Q7Z3Q1 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SLC46A3Q7Z3Q1 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SLC46A3Q7Z3Q1 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SLC46A3Q7Z3Q1 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SLC46A3Q7Z3Q1 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SLC46A3Q7Z3Q1 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SLC46A3Q7Z3Q1 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SLC46A3Q7Z3Q1 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SLC46A3Q7Z3Q1 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms