Protein–RNA interactions for Protein: Q7L1W4

LRRC8D, Volume-regulated anion channel subunit LRRC8D, humanhuman

Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC8DQ7L1W4 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
LRRC8DQ7L1W4 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LRRC8DQ7L1W4 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LRRC8DQ7L1W4 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LRRC8DQ7L1W4 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LRRC8DQ7L1W4 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LRRC8DQ7L1W4 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LRRC8DQ7L1W4 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LRRC8DQ7L1W4 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LRRC8DQ7L1W4 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LRRC8DQ7L1W4 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LRRC8DQ7L1W4 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LRRC8DQ7L1W4 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LRRC8DQ7L1W4 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LRRC8DQ7L1W4 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LRRC8DQ7L1W4 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LRRC8DQ7L1W4 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
LRRC8DQ7L1W4 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LRRC8DQ7L1W4 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LRRC8DQ7L1W4 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LRRC8DQ7L1W4 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LRRC8DQ7L1W4 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LRRC8DQ7L1W4 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LRRC8DQ7L1W4 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LRRC8DQ7L1W4 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LRRC8DQ7L1W4 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
LRRC8DQ7L1W4 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
LRRC8DQ7L1W4 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LRRC8DQ7L1W4 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LRRC8DQ7L1W4 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LRRC8DQ7L1W4 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LRRC8DQ7L1W4 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LRRC8DQ7L1W4 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRRC8DQ7L1W4 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
LRRC8DQ7L1W4 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRRC8DQ7L1W4 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRRC8DQ7L1W4 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRRC8DQ7L1W4 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRRC8DQ7L1W4 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRRC8DQ7L1W4 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRRC8DQ7L1W4 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRRC8DQ7L1W4 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRRC8DQ7L1W4 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRRC8DQ7L1W4 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRRC8DQ7L1W4 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRRC8DQ7L1W4 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
LRRC8DQ7L1W4 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRRC8DQ7L1W4 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
LRRC8DQ7L1W4 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRRC8DQ7L1W4 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
LRRC8DQ7L1W4 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRRC8DQ7L1W4 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRRC8DQ7L1W4 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LRRC8DQ7L1W4 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LRRC8DQ7L1W4 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LRRC8DQ7L1W4 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LRRC8DQ7L1W4 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LRRC8DQ7L1W4 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LRRC8DQ7L1W4 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LRRC8DQ7L1W4 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LRRC8DQ7L1W4 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LRRC8DQ7L1W4 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LRRC8DQ7L1W4 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LRRC8DQ7L1W4 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LRRC8DQ7L1W4 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LRRC8DQ7L1W4 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LRRC8DQ7L1W4 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LRRC8DQ7L1W4 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LRRC8DQ7L1W4 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LRRC8DQ7L1W4 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LRRC8DQ7L1W4 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
LRRC8DQ7L1W4 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LRRC8DQ7L1W4 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LRRC8DQ7L1W4 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
LRRC8DQ7L1W4 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LRRC8DQ7L1W4 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LRRC8DQ7L1W4 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LRRC8DQ7L1W4 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LRRC8DQ7L1W4 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LRRC8DQ7L1W4 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LRRC8DQ7L1W4 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LRRC8DQ7L1W4 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LRRC8DQ7L1W4 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRRC8DQ7L1W4 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRRC8DQ7L1W4 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRRC8DQ7L1W4 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRRC8DQ7L1W4 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRRC8DQ7L1W4 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRRC8DQ7L1W4 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRRC8DQ7L1W4 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRRC8DQ7L1W4 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRRC8DQ7L1W4 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRRC8DQ7L1W4 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRRC8DQ7L1W4 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRRC8DQ7L1W4 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRRC8DQ7L1W4 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRRC8DQ7L1W4 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LRRC8DQ7L1W4 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LRRC8DQ7L1W4 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LRRC8DQ7L1W4 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms