Protein–RNA interactions for Protein: Q7L099

RUFY3, Protein RUFY3, humanhuman

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUFY3Q7L099 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RUFY3Q7L099 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RUFY3Q7L099 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RUFY3Q7L099 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RUFY3Q7L099 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RUFY3Q7L099 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RUFY3Q7L099 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RUFY3Q7L099 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RUFY3Q7L099 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RUFY3Q7L099 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RUFY3Q7L099 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RUFY3Q7L099 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RUFY3Q7L099 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RUFY3Q7L099 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RUFY3Q7L099 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RUFY3Q7L099 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RUFY3Q7L099 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RUFY3Q7L099 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
RUFY3Q7L099 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RUFY3Q7L099 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RUFY3Q7L099 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RUFY3Q7L099 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RUFY3Q7L099 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RUFY3Q7L099 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RUFY3Q7L099 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RUFY3Q7L099 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RUFY3Q7L099 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RUFY3Q7L099 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RUFY3Q7L099 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RUFY3Q7L099 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RUFY3Q7L099 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RUFY3Q7L099 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RUFY3Q7L099 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RUFY3Q7L099 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RUFY3Q7L099 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
RUFY3Q7L099 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RUFY3Q7L099 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RUFY3Q7L099 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RUFY3Q7L099 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RUFY3Q7L099 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RUFY3Q7L099 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RUFY3Q7L099 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RUFY3Q7L099 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RUFY3Q7L099 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RUFY3Q7L099 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RUFY3Q7L099 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RUFY3Q7L099 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RUFY3Q7L099 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RUFY3Q7L099 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RUFY3Q7L099 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RUFY3Q7L099 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RUFY3Q7L099 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RUFY3Q7L099 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RUFY3Q7L099 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RUFY3Q7L099 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RUFY3Q7L099 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RUFY3Q7L099 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
RUFY3Q7L099 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RUFY3Q7L099 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RUFY3Q7L099 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RUFY3Q7L099 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RUFY3Q7L099 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RUFY3Q7L099 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RUFY3Q7L099 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RUFY3Q7L099 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RUFY3Q7L099 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RUFY3Q7L099 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RUFY3Q7L099 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RUFY3Q7L099 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RUFY3Q7L099 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RUFY3Q7L099 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RUFY3Q7L099 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RUFY3Q7L099 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RUFY3Q7L099 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RUFY3Q7L099 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RUFY3Q7L099 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RUFY3Q7L099 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RUFY3Q7L099 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RUFY3Q7L099 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RUFY3Q7L099 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
RUFY3Q7L099 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
RUFY3Q7L099 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RUFY3Q7L099 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RUFY3Q7L099 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RUFY3Q7L099 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
RUFY3Q7L099 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
RUFY3Q7L099 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
RUFY3Q7L099 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
RUFY3Q7L099 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
RUFY3Q7L099 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
RUFY3Q7L099 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC23.89■■□□□ 1.41
RUFY3Q7L099 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
RUFY3Q7L099 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
RUFY3Q7L099 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
RUFY3Q7L099 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
RUFY3Q7L099 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
RUFY3Q7L099 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
RUFY3Q7L099 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
RUFY3Q7L099 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
RUFY3Q7L099 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms