Protein–RNA interactions for Protein: Q76M96

CCDC80, Coiled-coil domain-containing protein 80, humanhuman

Predictions only

Length 950 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC80Q76M96 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC80Q76M96 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC80Q76M96 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC80Q76M96 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC80Q76M96 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC80Q76M96 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC80Q76M96 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC80Q76M96 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC80Q76M96 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC80Q76M96 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC80Q76M96 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC80Q76M96 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC80Q76M96 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC80Q76M96 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC80Q76M96 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC80Q76M96 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC80Q76M96 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC80Q76M96 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC80Q76M96 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC80Q76M96 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC80Q76M96 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC80Q76M96 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC80Q76M96 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CCDC80Q76M96 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CCDC80Q76M96 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CCDC80Q76M96 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CCDC80Q76M96 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CCDC80Q76M96 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CCDC80Q76M96 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CCDC80Q76M96 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CCDC80Q76M96 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CCDC80Q76M96 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CCDC80Q76M96 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CCDC80Q76M96 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CCDC80Q76M96 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CCDC80Q76M96 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CCDC80Q76M96 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CCDC80Q76M96 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CCDC80Q76M96 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CCDC80Q76M96 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CCDC80Q76M96 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CCDC80Q76M96 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CCDC80Q76M96 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CCDC80Q76M96 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC80Q76M96 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC80Q76M96 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC80Q76M96 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC80Q76M96 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC80Q76M96 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC80Q76M96 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC80Q76M96 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC80Q76M96 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC80Q76M96 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC80Q76M96 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC80Q76M96 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC80Q76M96 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC80Q76M96 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC80Q76M96 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC80Q76M96 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC80Q76M96 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC80Q76M96 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC80Q76M96 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC80Q76M96 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC80Q76M96 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC80Q76M96 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC80Q76M96 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC80Q76M96 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC80Q76M96 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC80Q76M96 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC80Q76M96 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC80Q76M96 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC80Q76M96 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC80Q76M96 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC80Q76M96 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC80Q76M96 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC80Q76M96 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC80Q76M96 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC80Q76M96 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC80Q76M96 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC80Q76M96 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC80Q76M96 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC80Q76M96 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC80Q76M96 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC80Q76M96 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC80Q76M96 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC80Q76M96 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC80Q76M96 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC80Q76M96 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC80Q76M96 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC80Q76M96 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC80Q76M96 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC80Q76M96 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC80Q76M96 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC80Q76M96 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC80Q76M96 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC80Q76M96 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC80Q76M96 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC80Q76M96 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC80Q76M96 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC80Q76M96 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms