Protein–RNA interactions for Protein: Q70EL4

USP43, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 43, humanhuman

Predictions only

Length 1,123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP43Q70EL4 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
USP43Q70EL4 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
USP43Q70EL4 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
USP43Q70EL4 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
USP43Q70EL4 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
USP43Q70EL4 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
USP43Q70EL4 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
USP43Q70EL4 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
USP43Q70EL4 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
USP43Q70EL4 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
USP43Q70EL4 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
USP43Q70EL4 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
USP43Q70EL4 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
USP43Q70EL4 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
USP43Q70EL4 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
USP43Q70EL4 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
USP43Q70EL4 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
USP43Q70EL4 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
USP43Q70EL4 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
USP43Q70EL4 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
USP43Q70EL4 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
USP43Q70EL4 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
USP43Q70EL4 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
USP43Q70EL4 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
USP43Q70EL4 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
USP43Q70EL4 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
USP43Q70EL4 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
USP43Q70EL4 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
USP43Q70EL4 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
USP43Q70EL4 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
USP43Q70EL4 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
USP43Q70EL4 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
USP43Q70EL4 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
USP43Q70EL4 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
USP43Q70EL4 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
USP43Q70EL4 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
USP43Q70EL4 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
USP43Q70EL4 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
USP43Q70EL4 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
USP43Q70EL4 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
USP43Q70EL4 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
USP43Q70EL4 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
USP43Q70EL4 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
USP43Q70EL4 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
USP43Q70EL4 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
USP43Q70EL4 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
USP43Q70EL4 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
USP43Q70EL4 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
USP43Q70EL4 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
USP43Q70EL4 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
USP43Q70EL4 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
USP43Q70EL4 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
USP43Q70EL4 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
USP43Q70EL4 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
USP43Q70EL4 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
USP43Q70EL4 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
USP43Q70EL4 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
USP43Q70EL4 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
USP43Q70EL4 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
USP43Q70EL4 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
USP43Q70EL4 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
USP43Q70EL4 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
USP43Q70EL4 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
USP43Q70EL4 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
USP43Q70EL4 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
USP43Q70EL4 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
USP43Q70EL4 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
USP43Q70EL4 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
USP43Q70EL4 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
USP43Q70EL4 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
USP43Q70EL4 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
USP43Q70EL4 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
USP43Q70EL4 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
USP43Q70EL4 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
USP43Q70EL4 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
USP43Q70EL4 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
USP43Q70EL4 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
USP43Q70EL4 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
USP43Q70EL4 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
USP43Q70EL4 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
USP43Q70EL4 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
USP43Q70EL4 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
USP43Q70EL4 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
USP43Q70EL4 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
USP43Q70EL4 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
USP43Q70EL4 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
USP43Q70EL4 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
USP43Q70EL4 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
USP43Q70EL4 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
USP43Q70EL4 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
USP43Q70EL4 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
USP43Q70EL4 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
USP43Q70EL4 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
USP43Q70EL4 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
USP43Q70EL4 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
USP43Q70EL4 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
USP43Q70EL4 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
USP43Q70EL4 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
USP43Q70EL4 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
USP43Q70EL4 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms