Protein–RNA interactions for Protein: Q702N8

XIRP1, Xin actin-binding repeat-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,843 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XIRP1Q702N8 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
XIRP1Q702N8 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
XIRP1Q702N8 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC28.25■■■□□ 2.11
XIRP1Q702N8 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
XIRP1Q702N8 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
XIRP1Q702N8 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
XIRP1Q702N8 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC28.25■■■□□ 2.11
XIRP1Q702N8 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
XIRP1Q702N8 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
XIRP1Q702N8 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
XIRP1Q702N8 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
XIRP1Q702N8 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
XIRP1Q702N8 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
XIRP1Q702N8 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
XIRP1Q702N8 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
XIRP1Q702N8 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
XIRP1Q702N8 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
XIRP1Q702N8 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
XIRP1Q702N8 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
XIRP1Q702N8 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
XIRP1Q702N8 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
XIRP1Q702N8 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
XIRP1Q702N8 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
XIRP1Q702N8 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
XIRP1Q702N8 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
XIRP1Q702N8 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
XIRP1Q702N8 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
XIRP1Q702N8 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
XIRP1Q702N8 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
XIRP1Q702N8 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
XIRP1Q702N8 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
XIRP1Q702N8 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
XIRP1Q702N8 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
XIRP1Q702N8 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
XIRP1Q702N8 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
XIRP1Q702N8 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
XIRP1Q702N8 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
XIRP1Q702N8 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
XIRP1Q702N8 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
XIRP1Q702N8 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
XIRP1Q702N8 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
XIRP1Q702N8 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
XIRP1Q702N8 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
XIRP1Q702N8 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
XIRP1Q702N8 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
XIRP1Q702N8 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
XIRP1Q702N8 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
XIRP1Q702N8 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
XIRP1Q702N8 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
XIRP1Q702N8 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
XIRP1Q702N8 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
XIRP1Q702N8 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
XIRP1Q702N8 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
XIRP1Q702N8 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
XIRP1Q702N8 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
XIRP1Q702N8 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
XIRP1Q702N8 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
XIRP1Q702N8 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
XIRP1Q702N8 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
XIRP1Q702N8 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
XIRP1Q702N8 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
XIRP1Q702N8 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
XIRP1Q702N8 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
XIRP1Q702N8 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
XIRP1Q702N8 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
XIRP1Q702N8 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
XIRP1Q702N8 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
XIRP1Q702N8 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
XIRP1Q702N8 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
XIRP1Q702N8 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
XIRP1Q702N8 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
XIRP1Q702N8 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
XIRP1Q702N8 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
XIRP1Q702N8 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
XIRP1Q702N8 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
XIRP1Q702N8 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
XIRP1Q702N8 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
XIRP1Q702N8 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
XIRP1Q702N8 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
XIRP1Q702N8 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
XIRP1Q702N8 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
XIRP1Q702N8 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
XIRP1Q702N8 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
XIRP1Q702N8 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
XIRP1Q702N8 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
XIRP1Q702N8 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
XIRP1Q702N8 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
XIRP1Q702N8 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
XIRP1Q702N8 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
XIRP1Q702N8 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
XIRP1Q702N8 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
XIRP1Q702N8 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
XIRP1Q702N8 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
XIRP1Q702N8 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
XIRP1Q702N8 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
XIRP1Q702N8 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
XIRP1Q702N8 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
XIRP1Q702N8 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
XIRP1Q702N8 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
XIRP1Q702N8 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms