Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZT07

TBC1D9, TBC1 domain family member 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,266 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TBC1D9Q6ZT07 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TBC1D9Q6ZT07 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TBC1D9Q6ZT07 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TBC1D9Q6ZT07 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TBC1D9Q6ZT07 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TBC1D9Q6ZT07 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TBC1D9Q6ZT07 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TBC1D9Q6ZT07 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
TBC1D9Q6ZT07 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TBC1D9Q6ZT07 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TBC1D9Q6ZT07 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TBC1D9Q6ZT07 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TBC1D9Q6ZT07 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TBC1D9Q6ZT07 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TBC1D9Q6ZT07 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TBC1D9Q6ZT07 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
TBC1D9Q6ZT07 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TBC1D9Q6ZT07 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TBC1D9Q6ZT07 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
TBC1D9Q6ZT07 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TBC1D9Q6ZT07 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TBC1D9Q6ZT07 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TBC1D9Q6ZT07 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TBC1D9Q6ZT07 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TBC1D9Q6ZT07 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TBC1D9Q6ZT07 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TBC1D9Q6ZT07 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
TBC1D9Q6ZT07 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TBC1D9Q6ZT07 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TBC1D9Q6ZT07 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TBC1D9Q6ZT07 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TBC1D9Q6ZT07 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TBC1D9Q6ZT07 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TBC1D9Q6ZT07 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TBC1D9Q6ZT07 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TBC1D9Q6ZT07 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TBC1D9Q6ZT07 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TBC1D9Q6ZT07 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TBC1D9Q6ZT07 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TBC1D9Q6ZT07 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
TBC1D9Q6ZT07 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TBC1D9Q6ZT07 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TBC1D9Q6ZT07 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TBC1D9Q6ZT07 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TBC1D9Q6ZT07 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TBC1D9Q6ZT07 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TBC1D9Q6ZT07 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TBC1D9Q6ZT07 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TBC1D9Q6ZT07 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TBC1D9Q6ZT07 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TBC1D9Q6ZT07 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TBC1D9Q6ZT07 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TBC1D9Q6ZT07 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TBC1D9Q6ZT07 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TBC1D9Q6ZT07 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TBC1D9Q6ZT07 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TBC1D9Q6ZT07 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TBC1D9Q6ZT07 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TBC1D9Q6ZT07 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TBC1D9Q6ZT07 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TBC1D9Q6ZT07 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TBC1D9Q6ZT07 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TBC1D9Q6ZT07 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TBC1D9Q6ZT07 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TBC1D9Q6ZT07 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TBC1D9Q6ZT07 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TBC1D9Q6ZT07 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TBC1D9Q6ZT07 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TBC1D9Q6ZT07 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TBC1D9Q6ZT07 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TBC1D9Q6ZT07 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TBC1D9Q6ZT07 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
TBC1D9Q6ZT07 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TBC1D9Q6ZT07 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
TBC1D9Q6ZT07 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
TBC1D9Q6ZT07 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TBC1D9Q6ZT07 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TBC1D9Q6ZT07 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TBC1D9Q6ZT07 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
TBC1D9Q6ZT07 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TBC1D9Q6ZT07 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
TBC1D9Q6ZT07 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC25■■□□□ 1.59
TBC1D9Q6ZT07 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
TBC1D9Q6ZT07 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TBC1D9Q6ZT07 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC25■■□□□ 1.59
TBC1D9Q6ZT07 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TBC1D9Q6ZT07 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TBC1D9Q6ZT07 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TBC1D9Q6ZT07 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TBC1D9Q6ZT07 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
TBC1D9Q6ZT07 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TBC1D9Q6ZT07 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TBC1D9Q6ZT07 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TBC1D9Q6ZT07 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TBC1D9Q6ZT07 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TBC1D9Q6ZT07 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TBC1D9Q6ZT07 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TBC1D9Q6ZT07 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TBC1D9Q6ZT07 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TBC1D9Q6ZT07 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms