Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMN7

PDZRN4, PDZ domain-containing RING finger protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,036 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDZRN4Q6ZMN7 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PDZRN4Q6ZMN7 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PDZRN4Q6ZMN7 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PDZRN4Q6ZMN7 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PDZRN4Q6ZMN7 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PDZRN4Q6ZMN7 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PDZRN4Q6ZMN7 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PDZRN4Q6ZMN7 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PDZRN4Q6ZMN7 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PDZRN4Q6ZMN7 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PDZRN4Q6ZMN7 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
PDZRN4Q6ZMN7 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PDZRN4Q6ZMN7 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PDZRN4Q6ZMN7 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PDZRN4Q6ZMN7 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PDZRN4Q6ZMN7 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
PDZRN4Q6ZMN7 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PDZRN4Q6ZMN7 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PDZRN4Q6ZMN7 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PDZRN4Q6ZMN7 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PDZRN4Q6ZMN7 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PDZRN4Q6ZMN7 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PDZRN4Q6ZMN7 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PDZRN4Q6ZMN7 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PDZRN4Q6ZMN7 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PDZRN4Q6ZMN7 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PDZRN4Q6ZMN7 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PDZRN4Q6ZMN7 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PDZRN4Q6ZMN7 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PDZRN4Q6ZMN7 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
PDZRN4Q6ZMN7 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PDZRN4Q6ZMN7 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PDZRN4Q6ZMN7 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PDZRN4Q6ZMN7 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PDZRN4Q6ZMN7 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PDZRN4Q6ZMN7 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PDZRN4Q6ZMN7 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PDZRN4Q6ZMN7 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PDZRN4Q6ZMN7 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PDZRN4Q6ZMN7 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PDZRN4Q6ZMN7 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PDZRN4Q6ZMN7 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PDZRN4Q6ZMN7 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PDZRN4Q6ZMN7 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PDZRN4Q6ZMN7 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
PDZRN4Q6ZMN7 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PDZRN4Q6ZMN7 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PDZRN4Q6ZMN7 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PDZRN4Q6ZMN7 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PDZRN4Q6ZMN7 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PDZRN4Q6ZMN7 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PDZRN4Q6ZMN7 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PDZRN4Q6ZMN7 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PDZRN4Q6ZMN7 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PDZRN4Q6ZMN7 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PDZRN4Q6ZMN7 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PDZRN4Q6ZMN7 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PDZRN4Q6ZMN7 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PDZRN4Q6ZMN7 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PDZRN4Q6ZMN7 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PDZRN4Q6ZMN7 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PDZRN4Q6ZMN7 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
PDZRN4Q6ZMN7 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PDZRN4Q6ZMN7 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PDZRN4Q6ZMN7 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PDZRN4Q6ZMN7 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PDZRN4Q6ZMN7 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PDZRN4Q6ZMN7 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PDZRN4Q6ZMN7 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PDZRN4Q6ZMN7 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PDZRN4Q6ZMN7 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PDZRN4Q6ZMN7 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
PDZRN4Q6ZMN7 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PDZRN4Q6ZMN7 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PDZRN4Q6ZMN7 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PDZRN4Q6ZMN7 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PDZRN4Q6ZMN7 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PDZRN4Q6ZMN7 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PDZRN4Q6ZMN7 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PDZRN4Q6ZMN7 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PDZRN4Q6ZMN7 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PDZRN4Q6ZMN7 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PDZRN4Q6ZMN7 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PDZRN4Q6ZMN7 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PDZRN4Q6ZMN7 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PDZRN4Q6ZMN7 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PDZRN4Q6ZMN7 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PDZRN4Q6ZMN7 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PDZRN4Q6ZMN7 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PDZRN4Q6ZMN7 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PDZRN4Q6ZMN7 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PDZRN4Q6ZMN7 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PDZRN4Q6ZMN7 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PDZRN4Q6ZMN7 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PDZRN4Q6ZMN7 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PDZRN4Q6ZMN7 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PDZRN4Q6ZMN7 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PDZRN4Q6ZMN7 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PDZRN4Q6ZMN7 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PDZRN4Q6ZMN7 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms