Protein–RNA interactions for Protein: Q6PB30

CSAG1, Putative chondrosarcoma-associated gene 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 78 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSAG1Q6PB30 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
CSAG1Q6PB30 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
CSAG1Q6PB30 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
CSAG1Q6PB30 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
CSAG1Q6PB30 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
CSAG1Q6PB30 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
CSAG1Q6PB30 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
CSAG1Q6PB30 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
CSAG1Q6PB30 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
CSAG1Q6PB30 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.34□□□□□ -0.75
CSAG1Q6PB30 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
CSAG1Q6PB30 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
CSAG1Q6PB30 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
CSAG1Q6PB30 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
CSAG1Q6PB30 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
CSAG1Q6PB30 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
CSAG1Q6PB30 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
CSAG1Q6PB30 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
CSAG1Q6PB30 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
CSAG1Q6PB30 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
CSAG1Q6PB30 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
CSAG1Q6PB30 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
CSAG1Q6PB30 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
CSAG1Q6PB30 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
CSAG1Q6PB30 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
CSAG1Q6PB30 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
CSAG1Q6PB30 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
CSAG1Q6PB30 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
CSAG1Q6PB30 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
CSAG1Q6PB30 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
CSAG1Q6PB30 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
CSAG1Q6PB30 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
CSAG1Q6PB30 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
CSAG1Q6PB30 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
CSAG1Q6PB30 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
CSAG1Q6PB30 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
CSAG1Q6PB30 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
CSAG1Q6PB30 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
CSAG1Q6PB30 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
CSAG1Q6PB30 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
CSAG1Q6PB30 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
CSAG1Q6PB30 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
CSAG1Q6PB30 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
CSAG1Q6PB30 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
CSAG1Q6PB30 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
CSAG1Q6PB30 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
CSAG1Q6PB30 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
CSAG1Q6PB30 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
CSAG1Q6PB30 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
CSAG1Q6PB30 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
CSAG1Q6PB30 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
CSAG1Q6PB30 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
CSAG1Q6PB30 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
CSAG1Q6PB30 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC10.34□□□□□ -0.75
CSAG1Q6PB30 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
CSAG1Q6PB30 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
CSAG1Q6PB30 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
CSAG1Q6PB30 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
CSAG1Q6PB30 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
CSAG1Q6PB30 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
CSAG1Q6PB30 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.75
CSAG1Q6PB30 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
CSAG1Q6PB30 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
CSAG1Q6PB30 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
CSAG1Q6PB30 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC10.33□□□□□ -0.76
CSAG1Q6PB30 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
CSAG1Q6PB30 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
CSAG1Q6PB30 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
CSAG1Q6PB30 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
CSAG1Q6PB30 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
CSAG1Q6PB30 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
CSAG1Q6PB30 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
CSAG1Q6PB30 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
CSAG1Q6PB30 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
CSAG1Q6PB30 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
CSAG1Q6PB30 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
CSAG1Q6PB30 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
CSAG1Q6PB30 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
CSAG1Q6PB30 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
CSAG1Q6PB30 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
CSAG1Q6PB30 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
CSAG1Q6PB30 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
CSAG1Q6PB30 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
CSAG1Q6PB30 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
CSAG1Q6PB30 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
CSAG1Q6PB30 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
CSAG1Q6PB30 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
CSAG1Q6PB30 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
CSAG1Q6PB30 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
CSAG1Q6PB30 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
CSAG1Q6PB30 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
CSAG1Q6PB30 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
CSAG1Q6PB30 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
CSAG1Q6PB30 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
CSAG1Q6PB30 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
CSAG1Q6PB30 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
CSAG1Q6PB30 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
CSAG1Q6PB30 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
CSAG1Q6PB30 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
CSAG1Q6PB30 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
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