Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZY7

CDC42EP5, Cdc42 effector protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC42EP5Q6NZY7 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CDC42EP5Q6NZY7 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CDC42EP5Q6NZY7 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CDC42EP5Q6NZY7 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CDC42EP5Q6NZY7 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CDC42EP5Q6NZY7 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CDC42EP5Q6NZY7 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CDC42EP5Q6NZY7 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CDC42EP5Q6NZY7 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CDC42EP5Q6NZY7 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CDC42EP5Q6NZY7 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CDC42EP5Q6NZY7 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CDC42EP5Q6NZY7 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CDC42EP5Q6NZY7 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
CDC42EP5Q6NZY7 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
CDC42EP5Q6NZY7 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CDC42EP5Q6NZY7 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.44
CDC42EP5Q6NZY7 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
CDC42EP5Q6NZY7 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CDC42EP5Q6NZY7 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CDC42EP5Q6NZY7 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CDC42EP5Q6NZY7 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CDC42EP5Q6NZY7 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CDC42EP5Q6NZY7 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CDC42EP5Q6NZY7 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CDC42EP5Q6NZY7 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CDC42EP5Q6NZY7 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CDC42EP5Q6NZY7 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CDC42EP5Q6NZY7 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CDC42EP5Q6NZY7 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CDC42EP5Q6NZY7 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CDC42EP5Q6NZY7 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CDC42EP5Q6NZY7 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CDC42EP5Q6NZY7 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CDC42EP5Q6NZY7 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
CDC42EP5Q6NZY7 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CDC42EP5Q6NZY7 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CDC42EP5Q6NZY7 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CDC42EP5Q6NZY7 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CDC42EP5Q6NZY7 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CDC42EP5Q6NZY7 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CDC42EP5Q6NZY7 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CDC42EP5Q6NZY7 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CDC42EP5Q6NZY7 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CDC42EP5Q6NZY7 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CDC42EP5Q6NZY7 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CDC42EP5Q6NZY7 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CDC42EP5Q6NZY7 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CDC42EP5Q6NZY7 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CDC42EP5Q6NZY7 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CDC42EP5Q6NZY7 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CDC42EP5Q6NZY7 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CDC42EP5Q6NZY7 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CDC42EP5Q6NZY7 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CDC42EP5Q6NZY7 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CDC42EP5Q6NZY7 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CDC42EP5Q6NZY7 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CDC42EP5Q6NZY7 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CDC42EP5Q6NZY7 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CDC42EP5Q6NZY7 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CDC42EP5Q6NZY7 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CDC42EP5Q6NZY7 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CDC42EP5Q6NZY7 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CDC42EP5Q6NZY7 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CDC42EP5Q6NZY7 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CDC42EP5Q6NZY7 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CDC42EP5Q6NZY7 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CDC42EP5Q6NZY7 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CDC42EP5Q6NZY7 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CDC42EP5Q6NZY7 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CDC42EP5Q6NZY7 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CDC42EP5Q6NZY7 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CDC42EP5Q6NZY7 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CDC42EP5Q6NZY7 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CDC42EP5Q6NZY7 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CDC42EP5Q6NZY7 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
CDC42EP5Q6NZY7 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CDC42EP5Q6NZY7 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CDC42EP5Q6NZY7 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CDC42EP5Q6NZY7 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CDC42EP5Q6NZY7 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CDC42EP5Q6NZY7 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CDC42EP5Q6NZY7 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CDC42EP5Q6NZY7 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CDC42EP5Q6NZY7 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CDC42EP5Q6NZY7 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CDC42EP5Q6NZY7 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CDC42EP5Q6NZY7 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CDC42EP5Q6NZY7 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CDC42EP5Q6NZY7 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CDC42EP5Q6NZY7 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CDC42EP5Q6NZY7 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CDC42EP5Q6NZY7 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CDC42EP5Q6NZY7 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CDC42EP5Q6NZY7 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CDC42EP5Q6NZY7 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CDC42EP5Q6NZY7 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CDC42EP5Q6NZY7 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CDC42EP5Q6NZY7 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CDC42EP5Q6NZY7 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.2 ms