Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXT1

ANKRD54, Ankyrin repeat domain-containing protein 54, humanhuman

Predictions only

Length 300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD54Q6NXT1 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ANKRD54Q6NXT1 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ANKRD54Q6NXT1 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ANKRD54Q6NXT1 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ANKRD54Q6NXT1 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ANKRD54Q6NXT1 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ANKRD54Q6NXT1 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ANKRD54Q6NXT1 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ANKRD54Q6NXT1 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ANKRD54Q6NXT1 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ANKRD54Q6NXT1 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ANKRD54Q6NXT1 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ANKRD54Q6NXT1 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ANKRD54Q6NXT1 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ANKRD54Q6NXT1 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ANKRD54Q6NXT1 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ANKRD54Q6NXT1 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ANKRD54Q6NXT1 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ANKRD54Q6NXT1 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ANKRD54Q6NXT1 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ANKRD54Q6NXT1 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ANKRD54Q6NXT1 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ANKRD54Q6NXT1 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ANKRD54Q6NXT1 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ANKRD54Q6NXT1 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ANKRD54Q6NXT1 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ANKRD54Q6NXT1 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ANKRD54Q6NXT1 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ANKRD54Q6NXT1 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ANKRD54Q6NXT1 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ANKRD54Q6NXT1 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ANKRD54Q6NXT1 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ANKRD54Q6NXT1 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
ANKRD54Q6NXT1 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ANKRD54Q6NXT1 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ANKRD54Q6NXT1 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ANKRD54Q6NXT1 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ANKRD54Q6NXT1 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ANKRD54Q6NXT1 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ANKRD54Q6NXT1 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ANKRD54Q6NXT1 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ANKRD54Q6NXT1 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ANKRD54Q6NXT1 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ANKRD54Q6NXT1 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ANKRD54Q6NXT1 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ANKRD54Q6NXT1 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ANKRD54Q6NXT1 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ANKRD54Q6NXT1 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
ANKRD54Q6NXT1 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
ANKRD54Q6NXT1 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
ANKRD54Q6NXT1 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ANKRD54Q6NXT1 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ANKRD54Q6NXT1 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ANKRD54Q6NXT1 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ANKRD54Q6NXT1 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ANKRD54Q6NXT1 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ANKRD54Q6NXT1 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ANKRD54Q6NXT1 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ANKRD54Q6NXT1 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ANKRD54Q6NXT1 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ANKRD54Q6NXT1 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ANKRD54Q6NXT1 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ANKRD54Q6NXT1 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ANKRD54Q6NXT1 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ANKRD54Q6NXT1 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
ANKRD54Q6NXT1 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ANKRD54Q6NXT1 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ANKRD54Q6NXT1 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ANKRD54Q6NXT1 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ANKRD54Q6NXT1 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ANKRD54Q6NXT1 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ANKRD54Q6NXT1 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ANKRD54Q6NXT1 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ANKRD54Q6NXT1 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ANKRD54Q6NXT1 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ANKRD54Q6NXT1 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
ANKRD54Q6NXT1 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ANKRD54Q6NXT1 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ANKRD54Q6NXT1 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
ANKRD54Q6NXT1 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ANKRD54Q6NXT1 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ANKRD54Q6NXT1 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ANKRD54Q6NXT1 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
ANKRD54Q6NXT1 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ANKRD54Q6NXT1 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ANKRD54Q6NXT1 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ANKRD54Q6NXT1 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ANKRD54Q6NXT1 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ANKRD54Q6NXT1 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ANKRD54Q6NXT1 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ANKRD54Q6NXT1 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ANKRD54Q6NXT1 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ANKRD54Q6NXT1 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ANKRD54Q6NXT1 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
ANKRD54Q6NXT1 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
ANKRD54Q6NXT1 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ANKRD54Q6NXT1 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ANKRD54Q6NXT1 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
ANKRD54Q6NXT1 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ANKRD54Q6NXT1 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms