Protein–RNA interactions for Protein: Q6NX49

ZNF544, Zinc finger protein 544, humanhuman

Predictions only

Length 715 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF544Q6NX49 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNF544Q6NX49 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNF544Q6NX49 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNF544Q6NX49 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNF544Q6NX49 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNF544Q6NX49 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNF544Q6NX49 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNF544Q6NX49 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNF544Q6NX49 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNF544Q6NX49 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNF544Q6NX49 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZNF544Q6NX49 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZNF544Q6NX49 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZNF544Q6NX49 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZNF544Q6NX49 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZNF544Q6NX49 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZNF544Q6NX49 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZNF544Q6NX49 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZNF544Q6NX49 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZNF544Q6NX49 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZNF544Q6NX49 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZNF544Q6NX49 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZNF544Q6NX49 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZNF544Q6NX49 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZNF544Q6NX49 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZNF544Q6NX49 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZNF544Q6NX49 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZNF544Q6NX49 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZNF544Q6NX49 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZNF544Q6NX49 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZNF544Q6NX49 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZNF544Q6NX49 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZNF544Q6NX49 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZNF544Q6NX49 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZNF544Q6NX49 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZNF544Q6NX49 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZNF544Q6NX49 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZNF544Q6NX49 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZNF544Q6NX49 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZNF544Q6NX49 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZNF544Q6NX49 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZNF544Q6NX49 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
ZNF544Q6NX49 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZNF544Q6NX49 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZNF544Q6NX49 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZNF544Q6NX49 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZNF544Q6NX49 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZNF544Q6NX49 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZNF544Q6NX49 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZNF544Q6NX49 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZNF544Q6NX49 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZNF544Q6NX49 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZNF544Q6NX49 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZNF544Q6NX49 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
ZNF544Q6NX49 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ZNF544Q6NX49 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ZNF544Q6NX49 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
ZNF544Q6NX49 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ZNF544Q6NX49 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ZNF544Q6NX49 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ZNF544Q6NX49 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ZNF544Q6NX49 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ZNF544Q6NX49 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ZNF544Q6NX49 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ZNF544Q6NX49 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ZNF544Q6NX49 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ZNF544Q6NX49 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ZNF544Q6NX49 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ZNF544Q6NX49 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ZNF544Q6NX49 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ZNF544Q6NX49 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ZNF544Q6NX49 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ZNF544Q6NX49 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ZNF544Q6NX49 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ZNF544Q6NX49 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ZNF544Q6NX49 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ZNF544Q6NX49 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ZNF544Q6NX49 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ZNF544Q6NX49 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
ZNF544Q6NX49 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
ZNF544Q6NX49 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
ZNF544Q6NX49 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
ZNF544Q6NX49 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
ZNF544Q6NX49 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZNF544Q6NX49 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZNF544Q6NX49 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZNF544Q6NX49 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZNF544Q6NX49 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZNF544Q6NX49 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZNF544Q6NX49 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZNF544Q6NX49 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZNF544Q6NX49 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZNF544Q6NX49 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZNF544Q6NX49 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZNF544Q6NX49 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZNF544Q6NX49 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZNF544Q6NX49 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZNF544Q6NX49 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZNF544Q6NX49 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZNF544Q6NX49 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms