Protein–RNA interactions for Protein: Q69YQ0

SPECC1L, Cytospin-A, humanhuman

Predictions only

Length 1,117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPECC1LQ69YQ0 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SPECC1LQ69YQ0 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SPECC1LQ69YQ0 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SPECC1LQ69YQ0 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SPECC1LQ69YQ0 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SPECC1LQ69YQ0 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SPECC1LQ69YQ0 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SPECC1LQ69YQ0 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SPECC1LQ69YQ0 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SPECC1LQ69YQ0 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SPECC1LQ69YQ0 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SPECC1LQ69YQ0 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SPECC1LQ69YQ0 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SPECC1LQ69YQ0 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SPECC1LQ69YQ0 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SPECC1LQ69YQ0 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SPECC1LQ69YQ0 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SPECC1LQ69YQ0 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SPECC1LQ69YQ0 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SPECC1LQ69YQ0 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SPECC1LQ69YQ0 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SPECC1LQ69YQ0 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SPECC1LQ69YQ0 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SPECC1LQ69YQ0 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SPECC1LQ69YQ0 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SPECC1LQ69YQ0 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SPECC1LQ69YQ0 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SPECC1LQ69YQ0 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SPECC1LQ69YQ0 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SPECC1LQ69YQ0 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SPECC1LQ69YQ0 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SPECC1LQ69YQ0 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SPECC1LQ69YQ0 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SPECC1LQ69YQ0 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SPECC1LQ69YQ0 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SPECC1LQ69YQ0 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SPECC1LQ69YQ0 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SPECC1LQ69YQ0 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SPECC1LQ69YQ0 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SPECC1LQ69YQ0 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SPECC1LQ69YQ0 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SPECC1LQ69YQ0 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SPECC1LQ69YQ0 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SPECC1LQ69YQ0 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SPECC1LQ69YQ0 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SPECC1LQ69YQ0 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SPECC1LQ69YQ0 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SPECC1LQ69YQ0 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SPECC1LQ69YQ0 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SPECC1LQ69YQ0 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SPECC1LQ69YQ0 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SPECC1LQ69YQ0 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SPECC1LQ69YQ0 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SPECC1LQ69YQ0 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SPECC1LQ69YQ0 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SPECC1LQ69YQ0 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SPECC1LQ69YQ0 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SPECC1LQ69YQ0 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SPECC1LQ69YQ0 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SPECC1LQ69YQ0 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SPECC1LQ69YQ0 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SPECC1LQ69YQ0 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SPECC1LQ69YQ0 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SPECC1LQ69YQ0 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SPECC1LQ69YQ0 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SPECC1LQ69YQ0 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SPECC1LQ69YQ0 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SPECC1LQ69YQ0 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SPECC1LQ69YQ0 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SPECC1LQ69YQ0 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SPECC1LQ69YQ0 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
SPECC1LQ69YQ0 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SPECC1LQ69YQ0 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SPECC1LQ69YQ0 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SPECC1LQ69YQ0 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SPECC1LQ69YQ0 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SPECC1LQ69YQ0 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SPECC1LQ69YQ0 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SPECC1LQ69YQ0 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
SPECC1LQ69YQ0 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SPECC1LQ69YQ0 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SPECC1LQ69YQ0 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
SPECC1LQ69YQ0 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SPECC1LQ69YQ0 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SPECC1LQ69YQ0 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SPECC1LQ69YQ0 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SPECC1LQ69YQ0 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SPECC1LQ69YQ0 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SPECC1LQ69YQ0 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SPECC1LQ69YQ0 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SPECC1LQ69YQ0 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SPECC1LQ69YQ0 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SPECC1LQ69YQ0 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SPECC1LQ69YQ0 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SPECC1LQ69YQ0 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SPECC1LQ69YQ0 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SPECC1LQ69YQ0 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SPECC1LQ69YQ0 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SPECC1LQ69YQ0 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SPECC1LQ69YQ0 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms