Protein–RNA interactions for Protein: Q5YKI7

GGNBP1, Putative gametogenetin-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGNBP1Q5YKI7 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GGNBP1Q5YKI7 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GGNBP1Q5YKI7 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GGNBP1Q5YKI7 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GGNBP1Q5YKI7 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GGNBP1Q5YKI7 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GGNBP1Q5YKI7 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GGNBP1Q5YKI7 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GGNBP1Q5YKI7 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GGNBP1Q5YKI7 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GGNBP1Q5YKI7 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GGNBP1Q5YKI7 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GGNBP1Q5YKI7 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GGNBP1Q5YKI7 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GGNBP1Q5YKI7 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GGNBP1Q5YKI7 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GGNBP1Q5YKI7 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GGNBP1Q5YKI7 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GGNBP1Q5YKI7 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GGNBP1Q5YKI7 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GGNBP1Q5YKI7 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GGNBP1Q5YKI7 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GGNBP1Q5YKI7 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GGNBP1Q5YKI7 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GGNBP1Q5YKI7 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GGNBP1Q5YKI7 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GGNBP1Q5YKI7 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GGNBP1Q5YKI7 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GGNBP1Q5YKI7 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
GGNBP1Q5YKI7 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GGNBP1Q5YKI7 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GGNBP1Q5YKI7 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GGNBP1Q5YKI7 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GGNBP1Q5YKI7 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GGNBP1Q5YKI7 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GGNBP1Q5YKI7 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GGNBP1Q5YKI7 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GGNBP1Q5YKI7 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GGNBP1Q5YKI7 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GGNBP1Q5YKI7 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GGNBP1Q5YKI7 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GGNBP1Q5YKI7 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GGNBP1Q5YKI7 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GGNBP1Q5YKI7 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GGNBP1Q5YKI7 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GGNBP1Q5YKI7 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GGNBP1Q5YKI7 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GGNBP1Q5YKI7 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GGNBP1Q5YKI7 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
GGNBP1Q5YKI7 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GGNBP1Q5YKI7 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GGNBP1Q5YKI7 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GGNBP1Q5YKI7 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GGNBP1Q5YKI7 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GGNBP1Q5YKI7 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GGNBP1Q5YKI7 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GGNBP1Q5YKI7 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GGNBP1Q5YKI7 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GGNBP1Q5YKI7 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GGNBP1Q5YKI7 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GGNBP1Q5YKI7 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GGNBP1Q5YKI7 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GGNBP1Q5YKI7 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GGNBP1Q5YKI7 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GGNBP1Q5YKI7 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GGNBP1Q5YKI7 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GGNBP1Q5YKI7 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GGNBP1Q5YKI7 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GGNBP1Q5YKI7 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GGNBP1Q5YKI7 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GGNBP1Q5YKI7 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GGNBP1Q5YKI7 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GGNBP1Q5YKI7 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GGNBP1Q5YKI7 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GGNBP1Q5YKI7 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GGNBP1Q5YKI7 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GGNBP1Q5YKI7 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
GGNBP1Q5YKI7 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GGNBP1Q5YKI7 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GGNBP1Q5YKI7 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GGNBP1Q5YKI7 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GGNBP1Q5YKI7 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GGNBP1Q5YKI7 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GGNBP1Q5YKI7 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GGNBP1Q5YKI7 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GGNBP1Q5YKI7 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GGNBP1Q5YKI7 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GGNBP1Q5YKI7 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GGNBP1Q5YKI7 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GGNBP1Q5YKI7 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GGNBP1Q5YKI7 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GGNBP1Q5YKI7 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GGNBP1Q5YKI7 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GGNBP1Q5YKI7 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GGNBP1Q5YKI7 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
GGNBP1Q5YKI7 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GGNBP1Q5YKI7 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GGNBP1Q5YKI7 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GGNBP1Q5YKI7 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GGNBP1Q5YKI7 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms