Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTL8

PRPF38B, Pre-mRNA-splicing factor 38B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 546 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF38BQ5VTL8 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
PRPF38BQ5VTL8 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRPF38BQ5VTL8 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRPF38BQ5VTL8 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRPF38BQ5VTL8 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRPF38BQ5VTL8 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRPF38BQ5VTL8 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRPF38BQ5VTL8 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRPF38BQ5VTL8 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRPF38BQ5VTL8 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRPF38BQ5VTL8 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRPF38BQ5VTL8 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRPF38BQ5VTL8 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRPF38BQ5VTL8 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRPF38BQ5VTL8 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRPF38BQ5VTL8 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRPF38BQ5VTL8 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRPF38BQ5VTL8 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRPF38BQ5VTL8 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRPF38BQ5VTL8 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRPF38BQ5VTL8 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRPF38BQ5VTL8 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRPF38BQ5VTL8 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRPF38BQ5VTL8 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRPF38BQ5VTL8 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRPF38BQ5VTL8 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRPF38BQ5VTL8 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRPF38BQ5VTL8 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRPF38BQ5VTL8 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRPF38BQ5VTL8 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRPF38BQ5VTL8 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRPF38BQ5VTL8 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRPF38BQ5VTL8 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
PRPF38BQ5VTL8 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
PRPF38BQ5VTL8 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRPF38BQ5VTL8 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRPF38BQ5VTL8 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRPF38BQ5VTL8 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRPF38BQ5VTL8 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
PRPF38BQ5VTL8 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRPF38BQ5VTL8 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRPF38BQ5VTL8 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRPF38BQ5VTL8 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRPF38BQ5VTL8 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRPF38BQ5VTL8 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRPF38BQ5VTL8 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRPF38BQ5VTL8 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRPF38BQ5VTL8 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
PRPF38BQ5VTL8 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
PRPF38BQ5VTL8 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
PRPF38BQ5VTL8 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
PRPF38BQ5VTL8 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRPF38BQ5VTL8 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRPF38BQ5VTL8 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRPF38BQ5VTL8 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRPF38BQ5VTL8 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRPF38BQ5VTL8 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRPF38BQ5VTL8 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRPF38BQ5VTL8 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRPF38BQ5VTL8 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRPF38BQ5VTL8 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
PRPF38BQ5VTL8 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRPF38BQ5VTL8 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
PRPF38BQ5VTL8 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PRPF38BQ5VTL8 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PRPF38BQ5VTL8 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PRPF38BQ5VTL8 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PRPF38BQ5VTL8 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PRPF38BQ5VTL8 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PRPF38BQ5VTL8 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PRPF38BQ5VTL8 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRPF38BQ5VTL8 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRPF38BQ5VTL8 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRPF38BQ5VTL8 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRPF38BQ5VTL8 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRPF38BQ5VTL8 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRPF38BQ5VTL8 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PRPF38BQ5VTL8 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRPF38BQ5VTL8 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PRPF38BQ5VTL8 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRPF38BQ5VTL8 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRPF38BQ5VTL8 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRPF38BQ5VTL8 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRPF38BQ5VTL8 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRPF38BQ5VTL8 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRPF38BQ5VTL8 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRPF38BQ5VTL8 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRPF38BQ5VTL8 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRPF38BQ5VTL8 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRPF38BQ5VTL8 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRPF38BQ5VTL8 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRPF38BQ5VTL8 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRPF38BQ5VTL8 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRPF38BQ5VTL8 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
PRPF38BQ5VTL8 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRPF38BQ5VTL8 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRPF38BQ5VTL8 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRPF38BQ5VTL8 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRPF38BQ5VTL8 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRPF38BQ5VTL8 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.6 ms