Protein–RNA interactions for Protein: Q5T7P8

SYT6, Synaptotagmin-6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 510 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT6Q5T7P8 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SYT6Q5T7P8 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SYT6Q5T7P8 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SYT6Q5T7P8 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SYT6Q5T7P8 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SYT6Q5T7P8 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SYT6Q5T7P8 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SYT6Q5T7P8 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SYT6Q5T7P8 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SYT6Q5T7P8 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SYT6Q5T7P8 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SYT6Q5T7P8 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SYT6Q5T7P8 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SYT6Q5T7P8 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SYT6Q5T7P8 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SYT6Q5T7P8 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SYT6Q5T7P8 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SYT6Q5T7P8 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SYT6Q5T7P8 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SYT6Q5T7P8 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SYT6Q5T7P8 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SYT6Q5T7P8 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SYT6Q5T7P8 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SYT6Q5T7P8 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SYT6Q5T7P8 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SYT6Q5T7P8 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SYT6Q5T7P8 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SYT6Q5T7P8 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SYT6Q5T7P8 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SYT6Q5T7P8 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SYT6Q5T7P8 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SYT6Q5T7P8 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SYT6Q5T7P8 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
SYT6Q5T7P8 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SYT6Q5T7P8 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SYT6Q5T7P8 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SYT6Q5T7P8 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SYT6Q5T7P8 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
SYT6Q5T7P8 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SYT6Q5T7P8 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SYT6Q5T7P8 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SYT6Q5T7P8 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SYT6Q5T7P8 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SYT6Q5T7P8 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SYT6Q5T7P8 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SYT6Q5T7P8 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SYT6Q5T7P8 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SYT6Q5T7P8 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SYT6Q5T7P8 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SYT6Q5T7P8 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SYT6Q5T7P8 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SYT6Q5T7P8 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SYT6Q5T7P8 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SYT6Q5T7P8 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SYT6Q5T7P8 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SYT6Q5T7P8 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SYT6Q5T7P8 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SYT6Q5T7P8 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SYT6Q5T7P8 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SYT6Q5T7P8 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SYT6Q5T7P8 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SYT6Q5T7P8 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
SYT6Q5T7P8 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
SYT6Q5T7P8 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SYT6Q5T7P8 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SYT6Q5T7P8 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SYT6Q5T7P8 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SYT6Q5T7P8 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SYT6Q5T7P8 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SYT6Q5T7P8 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SYT6Q5T7P8 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SYT6Q5T7P8 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SYT6Q5T7P8 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SYT6Q5T7P8 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SYT6Q5T7P8 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SYT6Q5T7P8 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SYT6Q5T7P8 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SYT6Q5T7P8 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SYT6Q5T7P8 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
SYT6Q5T7P8 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SYT6Q5T7P8 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SYT6Q5T7P8 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SYT6Q5T7P8 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SYT6Q5T7P8 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SYT6Q5T7P8 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SYT6Q5T7P8 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SYT6Q5T7P8 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SYT6Q5T7P8 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SYT6Q5T7P8 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SYT6Q5T7P8 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SYT6Q5T7P8 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
SYT6Q5T7P8 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SYT6Q5T7P8 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SYT6Q5T7P8 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SYT6Q5T7P8 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SYT6Q5T7P8 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SYT6Q5T7P8 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SYT6Q5T7P8 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SYT6Q5T7P8 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SYT6Q5T7P8 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms