Protein–RNA interactions for Protein: Q5T619

ZNF648, Zinc finger protein 648, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF648Q5T619 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
ZNF648Q5T619 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
ZNF648Q5T619 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
ZNF648Q5T619 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
ZNF648Q5T619 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
ZNF648Q5T619 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
ZNF648Q5T619 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ZNF648Q5T619 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ZNF648Q5T619 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ZNF648Q5T619 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ZNF648Q5T619 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ZNF648Q5T619 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ZNF648Q5T619 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ZNF648Q5T619 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ZNF648Q5T619 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ZNF648Q5T619 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ZNF648Q5T619 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ZNF648Q5T619 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ZNF648Q5T619 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ZNF648Q5T619 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ZNF648Q5T619 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ZNF648Q5T619 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ZNF648Q5T619 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ZNF648Q5T619 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC20■□□□□ 0.79
ZNF648Q5T619 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ZNF648Q5T619 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ZNF648Q5T619 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
ZNF648Q5T619 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
ZNF648Q5T619 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ZNF648Q5T619 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ZNF648Q5T619 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
ZNF648Q5T619 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ZNF648Q5T619 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
ZNF648Q5T619 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
ZNF648Q5T619 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ZNF648Q5T619 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ZNF648Q5T619 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
ZNF648Q5T619 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC20■□□□□ 0.79
ZNF648Q5T619 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
ZNF648Q5T619 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ZNF648Q5T619 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ZNF648Q5T619 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
ZNF648Q5T619 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ZNF648Q5T619 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
ZNF648Q5T619 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
ZNF648Q5T619 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ZNF648Q5T619 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
ZNF648Q5T619 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ZNF648Q5T619 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ZNF648Q5T619 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ZNF648Q5T619 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ZNF648Q5T619 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ZNF648Q5T619 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ZNF648Q5T619 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ZNF648Q5T619 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ZNF648Q5T619 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
ZNF648Q5T619 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ZNF648Q5T619 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ZNF648Q5T619 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ZNF648Q5T619 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
ZNF648Q5T619 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ZNF648Q5T619 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ZNF648Q5T619 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ZNF648Q5T619 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ZNF648Q5T619 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ZNF648Q5T619 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ZNF648Q5T619 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ZNF648Q5T619 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ZNF648Q5T619 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ZNF648Q5T619 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ZNF648Q5T619 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ZNF648Q5T619 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ZNF648Q5T619 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ZNF648Q5T619 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ZNF648Q5T619 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ZNF648Q5T619 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ZNF648Q5T619 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ZNF648Q5T619 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ZNF648Q5T619 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ZNF648Q5T619 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ZNF648Q5T619 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ZNF648Q5T619 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ZNF648Q5T619 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ZNF648Q5T619 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ZNF648Q5T619 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ZNF648Q5T619 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ZNF648Q5T619 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ZNF648Q5T619 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ZNF648Q5T619 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ZNF648Q5T619 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ZNF648Q5T619 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
ZNF648Q5T619 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ZNF648Q5T619 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ZNF648Q5T619 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ZNF648Q5T619 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ZNF648Q5T619 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ZNF648Q5T619 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ZNF648Q5T619 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ZNF648Q5T619 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ZNF648Q5T619 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.7 ms