Protein–RNA interactions for Protein: Q5JTW2

CEP78, Centrosomal protein of 78 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 689 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP78Q5JTW2 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CEP78Q5JTW2 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CEP78Q5JTW2 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CEP78Q5JTW2 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CEP78Q5JTW2 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CEP78Q5JTW2 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CEP78Q5JTW2 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CEP78Q5JTW2 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CEP78Q5JTW2 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CEP78Q5JTW2 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CEP78Q5JTW2 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CEP78Q5JTW2 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CEP78Q5JTW2 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CEP78Q5JTW2 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CEP78Q5JTW2 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CEP78Q5JTW2 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CEP78Q5JTW2 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CEP78Q5JTW2 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CEP78Q5JTW2 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CEP78Q5JTW2 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CEP78Q5JTW2 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CEP78Q5JTW2 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CEP78Q5JTW2 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CEP78Q5JTW2 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CEP78Q5JTW2 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CEP78Q5JTW2 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CEP78Q5JTW2 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CEP78Q5JTW2 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CEP78Q5JTW2 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CEP78Q5JTW2 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CEP78Q5JTW2 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CEP78Q5JTW2 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CEP78Q5JTW2 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CEP78Q5JTW2 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CEP78Q5JTW2 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CEP78Q5JTW2 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CEP78Q5JTW2 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CEP78Q5JTW2 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CEP78Q5JTW2 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CEP78Q5JTW2 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CEP78Q5JTW2 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CEP78Q5JTW2 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CEP78Q5JTW2 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CEP78Q5JTW2 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CEP78Q5JTW2 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CEP78Q5JTW2 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CEP78Q5JTW2 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CEP78Q5JTW2 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CEP78Q5JTW2 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CEP78Q5JTW2 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CEP78Q5JTW2 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
CEP78Q5JTW2 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CEP78Q5JTW2 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CEP78Q5JTW2 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
CEP78Q5JTW2 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CEP78Q5JTW2 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CEP78Q5JTW2 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CEP78Q5JTW2 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CEP78Q5JTW2 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CEP78Q5JTW2 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CEP78Q5JTW2 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CEP78Q5JTW2 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CEP78Q5JTW2 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CEP78Q5JTW2 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CEP78Q5JTW2 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CEP78Q5JTW2 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CEP78Q5JTW2 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CEP78Q5JTW2 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CEP78Q5JTW2 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CEP78Q5JTW2 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CEP78Q5JTW2 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
CEP78Q5JTW2 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CEP78Q5JTW2 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CEP78Q5JTW2 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CEP78Q5JTW2 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CEP78Q5JTW2 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CEP78Q5JTW2 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CEP78Q5JTW2 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CEP78Q5JTW2 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CEP78Q5JTW2 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
CEP78Q5JTW2 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
CEP78Q5JTW2 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CEP78Q5JTW2 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CEP78Q5JTW2 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CEP78Q5JTW2 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CEP78Q5JTW2 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CEP78Q5JTW2 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CEP78Q5JTW2 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CEP78Q5JTW2 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CEP78Q5JTW2 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CEP78Q5JTW2 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CEP78Q5JTW2 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
CEP78Q5JTW2 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CEP78Q5JTW2 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
CEP78Q5JTW2 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
CEP78Q5JTW2 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
CEP78Q5JTW2 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
CEP78Q5JTW2 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
CEP78Q5JTW2 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CEP78Q5JTW2 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms