Protein–RNA interactions for Protein: Q59GN2

RPL39P5, Putative 60S ribosomal protein L39-like 5, humanhuman

Predictions only

Length 51 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL39P5Q59GN2 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RPL39P5Q59GN2 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RPL39P5Q59GN2 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RPL39P5Q59GN2 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RPL39P5Q59GN2 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RPL39P5Q59GN2 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RPL39P5Q59GN2 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RPL39P5Q59GN2 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RPL39P5Q59GN2 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RPL39P5Q59GN2 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RPL39P5Q59GN2 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RPL39P5Q59GN2 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RPL39P5Q59GN2 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RPL39P5Q59GN2 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
RPL39P5Q59GN2 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RPL39P5Q59GN2 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RPL39P5Q59GN2 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RPL39P5Q59GN2 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RPL39P5Q59GN2 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RPL39P5Q59GN2 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RPL39P5Q59GN2 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RPL39P5Q59GN2 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RPL39P5Q59GN2 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RPL39P5Q59GN2 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RPL39P5Q59GN2 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RPL39P5Q59GN2 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RPL39P5Q59GN2 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RPL39P5Q59GN2 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RPL39P5Q59GN2 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RPL39P5Q59GN2 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RPL39P5Q59GN2 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RPL39P5Q59GN2 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RPL39P5Q59GN2 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RPL39P5Q59GN2 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RPL39P5Q59GN2 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RPL39P5Q59GN2 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
RPL39P5Q59GN2 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
RPL39P5Q59GN2 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RPL39P5Q59GN2 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RPL39P5Q59GN2 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
RPL39P5Q59GN2 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
RPL39P5Q59GN2 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RPL39P5Q59GN2 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RPL39P5Q59GN2 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RPL39P5Q59GN2 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RPL39P5Q59GN2 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RPL39P5Q59GN2 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RPL39P5Q59GN2 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RPL39P5Q59GN2 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RPL39P5Q59GN2 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RPL39P5Q59GN2 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RPL39P5Q59GN2 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RPL39P5Q59GN2 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RPL39P5Q59GN2 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RPL39P5Q59GN2 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RPL39P5Q59GN2 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RPL39P5Q59GN2 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RPL39P5Q59GN2 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RPL39P5Q59GN2 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RPL39P5Q59GN2 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RPL39P5Q59GN2 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RPL39P5Q59GN2 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RPL39P5Q59GN2 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RPL39P5Q59GN2 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RPL39P5Q59GN2 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RPL39P5Q59GN2 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RPL39P5Q59GN2 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RPL39P5Q59GN2 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RPL39P5Q59GN2 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RPL39P5Q59GN2 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RPL39P5Q59GN2 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RPL39P5Q59GN2 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RPL39P5Q59GN2 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RPL39P5Q59GN2 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RPL39P5Q59GN2 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RPL39P5Q59GN2 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RPL39P5Q59GN2 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RPL39P5Q59GN2 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RPL39P5Q59GN2 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RPL39P5Q59GN2 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RPL39P5Q59GN2 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RPL39P5Q59GN2 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RPL39P5Q59GN2 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RPL39P5Q59GN2 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RPL39P5Q59GN2 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RPL39P5Q59GN2 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RPL39P5Q59GN2 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RPL39P5Q59GN2 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RPL39P5Q59GN2 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RPL39P5Q59GN2 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RPL39P5Q59GN2 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
RPL39P5Q59GN2 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RPL39P5Q59GN2 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RPL39P5Q59GN2 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RPL39P5Q59GN2 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RPL39P5Q59GN2 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RPL39P5Q59GN2 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RPL39P5Q59GN2 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RPL39P5Q59GN2 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
RPL39P5Q59GN2 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms