Protein–RNA interactions for Protein: Q53RE8

ANKRD39, Ankyrin repeat domain-containing protein 39, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD39Q53RE8 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
ANKRD39Q53RE8 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
ANKRD39Q53RE8 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
ANKRD39Q53RE8 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
ANKRD39Q53RE8 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
ANKRD39Q53RE8 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
ANKRD39Q53RE8 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
ANKRD39Q53RE8 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
ANKRD39Q53RE8 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
ANKRD39Q53RE8 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
ANKRD39Q53RE8 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ANKRD39Q53RE8 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ANKRD39Q53RE8 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ANKRD39Q53RE8 ITGB2-206ENST00000397852 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ANKRD39Q53RE8 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ANKRD39Q53RE8 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ANKRD39Q53RE8 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ANKRD39Q53RE8 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ANKRD39Q53RE8 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ANKRD39Q53RE8 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ANKRD39Q53RE8 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ANKRD39Q53RE8 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ANKRD39Q53RE8 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ANKRD39Q53RE8 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ANKRD39Q53RE8 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ANKRD39Q53RE8 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ANKRD39Q53RE8 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ANKRD39Q53RE8 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ANKRD39Q53RE8 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ANKRD39Q53RE8 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ANKRD39Q53RE8 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ANKRD39Q53RE8 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ANKRD39Q53RE8 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ANKRD39Q53RE8 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ANKRD39Q53RE8 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ANKRD39Q53RE8 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ANKRD39Q53RE8 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ANKRD39Q53RE8 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ANKRD39Q53RE8 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ANKRD39Q53RE8 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ANKRD39Q53RE8 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ANKRD39Q53RE8 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ANKRD39Q53RE8 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ANKRD39Q53RE8 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ANKRD39Q53RE8 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ANKRD39Q53RE8 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ANKRD39Q53RE8 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ANKRD39Q53RE8 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ANKRD39Q53RE8 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ANKRD39Q53RE8 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ANKRD39Q53RE8 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ANKRD39Q53RE8 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ANKRD39Q53RE8 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ANKRD39Q53RE8 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ANKRD39Q53RE8 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ANKRD39Q53RE8 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ANKRD39Q53RE8 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ANKRD39Q53RE8 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ANKRD39Q53RE8 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ANKRD39Q53RE8 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ANKRD39Q53RE8 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ANKRD39Q53RE8 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ANKRD39Q53RE8 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ANKRD39Q53RE8 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ANKRD39Q53RE8 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ANKRD39Q53RE8 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ANKRD39Q53RE8 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ANKRD39Q53RE8 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ANKRD39Q53RE8 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ANKRD39Q53RE8 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ANKRD39Q53RE8 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ANKRD39Q53RE8 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ANKRD39Q53RE8 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ANKRD39Q53RE8 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ANKRD39Q53RE8 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ANKRD39Q53RE8 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ANKRD39Q53RE8 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ANKRD39Q53RE8 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ANKRD39Q53RE8 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ANKRD39Q53RE8 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ANKRD39Q53RE8 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ANKRD39Q53RE8 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ANKRD39Q53RE8 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ANKRD39Q53RE8 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ANKRD39Q53RE8 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ANKRD39Q53RE8 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ANKRD39Q53RE8 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ANKRD39Q53RE8 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ANKRD39Q53RE8 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
ANKRD39Q53RE8 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ANKRD39Q53RE8 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
ANKRD39Q53RE8 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
ANKRD39Q53RE8 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
ANKRD39Q53RE8 USP31-203ENST00000567975 2142 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
ANKRD39Q53RE8 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ANKRD39Q53RE8 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ANKRD39Q53RE8 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ANKRD39Q53RE8 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ANKRD39Q53RE8 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
ANKRD39Q53RE8 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms