Protein–RNA interactions for Protein: Q494V2

CFAP100, Cilia- and flagella-associated protein 100, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP100Q494V2 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CFAP100Q494V2 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CFAP100Q494V2 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CFAP100Q494V2 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CFAP100Q494V2 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CFAP100Q494V2 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CFAP100Q494V2 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CFAP100Q494V2 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CFAP100Q494V2 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CFAP100Q494V2 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CFAP100Q494V2 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CFAP100Q494V2 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CFAP100Q494V2 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CFAP100Q494V2 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CFAP100Q494V2 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CFAP100Q494V2 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CFAP100Q494V2 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CFAP100Q494V2 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CFAP100Q494V2 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CFAP100Q494V2 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CFAP100Q494V2 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CFAP100Q494V2 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CFAP100Q494V2 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CFAP100Q494V2 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CFAP100Q494V2 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CFAP100Q494V2 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CFAP100Q494V2 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CFAP100Q494V2 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CFAP100Q494V2 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CFAP100Q494V2 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CFAP100Q494V2 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CFAP100Q494V2 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CFAP100Q494V2 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CFAP100Q494V2 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CFAP100Q494V2 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CFAP100Q494V2 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CFAP100Q494V2 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CFAP100Q494V2 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CFAP100Q494V2 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
CFAP100Q494V2 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CFAP100Q494V2 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
CFAP100Q494V2 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CFAP100Q494V2 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CFAP100Q494V2 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CFAP100Q494V2 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CFAP100Q494V2 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CFAP100Q494V2 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CFAP100Q494V2 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CFAP100Q494V2 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CFAP100Q494V2 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CFAP100Q494V2 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CFAP100Q494V2 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CFAP100Q494V2 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CFAP100Q494V2 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CFAP100Q494V2 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CFAP100Q494V2 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CFAP100Q494V2 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CFAP100Q494V2 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CFAP100Q494V2 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CFAP100Q494V2 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CFAP100Q494V2 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CFAP100Q494V2 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CFAP100Q494V2 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CFAP100Q494V2 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CFAP100Q494V2 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CFAP100Q494V2 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CFAP100Q494V2 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
CFAP100Q494V2 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CFAP100Q494V2 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
CFAP100Q494V2 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CFAP100Q494V2 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CFAP100Q494V2 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CFAP100Q494V2 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CFAP100Q494V2 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
CFAP100Q494V2 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CFAP100Q494V2 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CFAP100Q494V2 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CFAP100Q494V2 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CFAP100Q494V2 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CFAP100Q494V2 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CFAP100Q494V2 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CFAP100Q494V2 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CFAP100Q494V2 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CFAP100Q494V2 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CFAP100Q494V2 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CFAP100Q494V2 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CFAP100Q494V2 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
CFAP100Q494V2 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
CFAP100Q494V2 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CFAP100Q494V2 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CFAP100Q494V2 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CFAP100Q494V2 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CFAP100Q494V2 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CFAP100Q494V2 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CFAP100Q494V2 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CFAP100Q494V2 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CFAP100Q494V2 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
CFAP100Q494V2 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CFAP100Q494V2 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CFAP100Q494V2 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
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