Protein–RNA interactions for Protein: Q17RS7

GEN1, Flap endonuclease GEN homolog 1, humanhuman

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Length 908 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GEN1Q17RS7 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
GEN1Q17RS7 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
GEN1Q17RS7 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
GEN1Q17RS7 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
GEN1Q17RS7 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
GEN1Q17RS7 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC20.94■□□□□ 0.94
GEN1Q17RS7 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
GEN1Q17RS7 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
GEN1Q17RS7 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
GEN1Q17RS7 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
GEN1Q17RS7 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
GEN1Q17RS7 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
GEN1Q17RS7 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
GEN1Q17RS7 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
GEN1Q17RS7 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
GEN1Q17RS7 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
GEN1Q17RS7 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
GEN1Q17RS7 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
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GEN1Q17RS7 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
GEN1Q17RS7 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
GEN1Q17RS7 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
GEN1Q17RS7 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
GEN1Q17RS7 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
GEN1Q17RS7 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
GEN1Q17RS7 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
GEN1Q17RS7 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
GEN1Q17RS7 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
GEN1Q17RS7 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
GEN1Q17RS7 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
GEN1Q17RS7 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
GEN1Q17RS7 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
GEN1Q17RS7 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
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GEN1Q17RS7 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
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GEN1Q17RS7 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
GEN1Q17RS7 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
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GEN1Q17RS7 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
GEN1Q17RS7 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
GEN1Q17RS7 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
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GEN1Q17RS7 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
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GEN1Q17RS7 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
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GEN1Q17RS7 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
GEN1Q17RS7 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
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GEN1Q17RS7 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
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GEN1Q17RS7 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
GEN1Q17RS7 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
GEN1Q17RS7 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
GEN1Q17RS7 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
GEN1Q17RS7 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
GEN1Q17RS7 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
GEN1Q17RS7 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
GEN1Q17RS7 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.9■□□□□ 0.94
GEN1Q17RS7 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
GEN1Q17RS7 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
GEN1Q17RS7 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
GEN1Q17RS7 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
GEN1Q17RS7 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
GEN1Q17RS7 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
GEN1Q17RS7 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
GEN1Q17RS7 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
GEN1Q17RS7 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
GEN1Q17RS7 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
GEN1Q17RS7 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
GEN1Q17RS7 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
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