Protein–RNA interactions for Protein: Q17RM4

CCDC142, Coiled-coil domain-containing protein 142, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC142Q17RM4 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CCDC142Q17RM4 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CCDC142Q17RM4 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CCDC142Q17RM4 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
CCDC142Q17RM4 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CCDC142Q17RM4 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CCDC142Q17RM4 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CCDC142Q17RM4 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CCDC142Q17RM4 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CCDC142Q17RM4 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC142Q17RM4 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC142Q17RM4 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC142Q17RM4 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC142Q17RM4 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC142Q17RM4 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC142Q17RM4 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC142Q17RM4 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC142Q17RM4 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC142Q17RM4 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC142Q17RM4 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC142Q17RM4 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC142Q17RM4 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC142Q17RM4 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC142Q17RM4 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC142Q17RM4 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC142Q17RM4 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC142Q17RM4 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC142Q17RM4 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC142Q17RM4 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC142Q17RM4 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC142Q17RM4 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC142Q17RM4 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC142Q17RM4 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC142Q17RM4 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC142Q17RM4 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC142Q17RM4 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC142Q17RM4 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC142Q17RM4 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC142Q17RM4 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC142Q17RM4 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC142Q17RM4 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC142Q17RM4 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC142Q17RM4 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC142Q17RM4 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC142Q17RM4 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC142Q17RM4 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC142Q17RM4 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC142Q17RM4 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC142Q17RM4 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC142Q17RM4 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC142Q17RM4 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC142Q17RM4 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC142Q17RM4 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC142Q17RM4 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC142Q17RM4 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC142Q17RM4 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC142Q17RM4 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC142Q17RM4 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC142Q17RM4 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC142Q17RM4 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC142Q17RM4 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC142Q17RM4 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC142Q17RM4 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC142Q17RM4 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC142Q17RM4 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC142Q17RM4 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC142Q17RM4 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC142Q17RM4 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC142Q17RM4 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC142Q17RM4 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC142Q17RM4 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC142Q17RM4 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC142Q17RM4 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC142Q17RM4 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC142Q17RM4 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC142Q17RM4 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC142Q17RM4 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC142Q17RM4 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC142Q17RM4 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC142Q17RM4 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC142Q17RM4 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC142Q17RM4 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC142Q17RM4 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC142Q17RM4 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC142Q17RM4 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC142Q17RM4 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC142Q17RM4 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC142Q17RM4 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC142Q17RM4 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC142Q17RM4 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC142Q17RM4 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC142Q17RM4 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC142Q17RM4 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC142Q17RM4 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC142Q17RM4 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC142Q17RM4 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC142Q17RM4 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC142Q17RM4 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC142Q17RM4 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC142Q17RM4 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
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