Protein–RNA interactions for Protein: Q17R55

FAM187B, Protein FAM187B, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM187BQ17R55 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FAM187BQ17R55 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FAM187BQ17R55 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FAM187BQ17R55 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FAM187BQ17R55 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FAM187BQ17R55 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FAM187BQ17R55 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FAM187BQ17R55 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FAM187BQ17R55 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FAM187BQ17R55 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FAM187BQ17R55 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
FAM187BQ17R55 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.11
FAM187BQ17R55 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FAM187BQ17R55 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FAM187BQ17R55 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FAM187BQ17R55 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FAM187BQ17R55 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FAM187BQ17R55 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FAM187BQ17R55 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FAM187BQ17R55 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FAM187BQ17R55 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FAM187BQ17R55 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FAM187BQ17R55 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FAM187BQ17R55 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FAM187BQ17R55 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FAM187BQ17R55 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
FAM187BQ17R55 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
FAM187BQ17R55 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FAM187BQ17R55 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FAM187BQ17R55 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FAM187BQ17R55 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FAM187BQ17R55 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FAM187BQ17R55 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FAM187BQ17R55 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FAM187BQ17R55 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
FAM187BQ17R55 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
FAM187BQ17R55 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
FAM187BQ17R55 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FAM187BQ17R55 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FAM187BQ17R55 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FAM187BQ17R55 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FAM187BQ17R55 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
FAM187BQ17R55 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
FAM187BQ17R55 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FAM187BQ17R55 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
FAM187BQ17R55 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
FAM187BQ17R55 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FAM187BQ17R55 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FAM187BQ17R55 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FAM187BQ17R55 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
FAM187BQ17R55 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FAM187BQ17R55 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FAM187BQ17R55 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FAM187BQ17R55 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FAM187BQ17R55 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FAM187BQ17R55 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FAM187BQ17R55 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FAM187BQ17R55 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FAM187BQ17R55 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FAM187BQ17R55 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FAM187BQ17R55 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FAM187BQ17R55 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FAM187BQ17R55 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FAM187BQ17R55 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FAM187BQ17R55 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FAM187BQ17R55 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FAM187BQ17R55 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
FAM187BQ17R55 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
FAM187BQ17R55 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FAM187BQ17R55 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FAM187BQ17R55 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
FAM187BQ17R55 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
FAM187BQ17R55 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FAM187BQ17R55 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
FAM187BQ17R55 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FAM187BQ17R55 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FAM187BQ17R55 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
FAM187BQ17R55 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FAM187BQ17R55 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FAM187BQ17R55 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
FAM187BQ17R55 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
FAM187BQ17R55 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
FAM187BQ17R55 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FAM187BQ17R55 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FAM187BQ17R55 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
FAM187BQ17R55 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
FAM187BQ17R55 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FAM187BQ17R55 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
FAM187BQ17R55 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
FAM187BQ17R55 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
FAM187BQ17R55 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
FAM187BQ17R55 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
FAM187BQ17R55 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FAM187BQ17R55 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FAM187BQ17R55 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
FAM187BQ17R55 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FAM187BQ17R55 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
FAM187BQ17R55 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
FAM187BQ17R55 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
FAM187BQ17R55 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
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