Protein–RNA interactions for Protein: Q16740

CLPP, ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 277 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLPPQ16740 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CLPPQ16740 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CLPPQ16740 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CLPPQ16740 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CLPPQ16740 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CLPPQ16740 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CLPPQ16740 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CLPPQ16740 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CLPPQ16740 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CLPPQ16740 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CLPPQ16740 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CLPPQ16740 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CLPPQ16740 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CLPPQ16740 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
CLPPQ16740 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CLPPQ16740 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CLPPQ16740 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CLPPQ16740 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CLPPQ16740 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CLPPQ16740 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CLPPQ16740 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CLPPQ16740 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CLPPQ16740 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CLPPQ16740 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CLPPQ16740 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CLPPQ16740 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CLPPQ16740 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CLPPQ16740 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CLPPQ16740 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CLPPQ16740 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CLPPQ16740 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CLPPQ16740 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CLPPQ16740 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CLPPQ16740 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CLPPQ16740 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CLPPQ16740 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CLPPQ16740 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CLPPQ16740 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CLPPQ16740 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CLPPQ16740 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CLPPQ16740 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CLPPQ16740 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CLPPQ16740 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CLPPQ16740 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CLPPQ16740 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CLPPQ16740 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CLPPQ16740 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CLPPQ16740 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CLPPQ16740 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CLPPQ16740 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CLPPQ16740 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CLPPQ16740 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CLPPQ16740 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CLPPQ16740 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CLPPQ16740 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CLPPQ16740 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CLPPQ16740 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CLPPQ16740 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CLPPQ16740 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
CLPPQ16740 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CLPPQ16740 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CLPPQ16740 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CLPPQ16740 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CLPPQ16740 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CLPPQ16740 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
CLPPQ16740 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CLPPQ16740 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CLPPQ16740 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CLPPQ16740 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CLPPQ16740 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CLPPQ16740 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CLPPQ16740 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CLPPQ16740 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CLPPQ16740 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CLPPQ16740 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CLPPQ16740 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CLPPQ16740 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CLPPQ16740 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CLPPQ16740 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CLPPQ16740 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CLPPQ16740 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CLPPQ16740 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CLPPQ16740 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CLPPQ16740 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CLPPQ16740 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CLPPQ16740 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CLPPQ16740 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
CLPPQ16740 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CLPPQ16740 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CLPPQ16740 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CLPPQ16740 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CLPPQ16740 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CLPPQ16740 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CLPPQ16740 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CLPPQ16740 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CLPPQ16740 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CLPPQ16740 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CLPPQ16740 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CLPPQ16740 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
CLPPQ16740 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
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