Protein–RNA interactions for Protein: Q16695

HIST3H3, Histone H3.1t, humanhuman

Predictions only

Length 136 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIST3H3Q16695 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HIST3H3Q16695 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HIST3H3Q16695 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HIST3H3Q16695 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HIST3H3Q16695 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HIST3H3Q16695 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HIST3H3Q16695 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HIST3H3Q16695 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HIST3H3Q16695 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HIST3H3Q16695 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HIST3H3Q16695 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HIST3H3Q16695 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HIST3H3Q16695 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HIST3H3Q16695 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HIST3H3Q16695 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HIST3H3Q16695 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HIST3H3Q16695 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HIST3H3Q16695 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HIST3H3Q16695 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HIST3H3Q16695 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HIST3H3Q16695 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HIST3H3Q16695 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
HIST3H3Q16695 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HIST3H3Q16695 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
HIST3H3Q16695 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HIST3H3Q16695 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HIST3H3Q16695 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
HIST3H3Q16695 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HIST3H3Q16695 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HIST3H3Q16695 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HIST3H3Q16695 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HIST3H3Q16695 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HIST3H3Q16695 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HIST3H3Q16695 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HIST3H3Q16695 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HIST3H3Q16695 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HIST3H3Q16695 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HIST3H3Q16695 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HIST3H3Q16695 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HIST3H3Q16695 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HIST3H3Q16695 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HIST3H3Q16695 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HIST3H3Q16695 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HIST3H3Q16695 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HIST3H3Q16695 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HIST3H3Q16695 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HIST3H3Q16695 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HIST3H3Q16695 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HIST3H3Q16695 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HIST3H3Q16695 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
HIST3H3Q16695 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HIST3H3Q16695 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HIST3H3Q16695 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HIST3H3Q16695 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HIST3H3Q16695 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HIST3H3Q16695 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HIST3H3Q16695 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HIST3H3Q16695 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HIST3H3Q16695 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HIST3H3Q16695 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HIST3H3Q16695 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HIST3H3Q16695 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HIST3H3Q16695 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HIST3H3Q16695 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HIST3H3Q16695 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
HIST3H3Q16695 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HIST3H3Q16695 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HIST3H3Q16695 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HIST3H3Q16695 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HIST3H3Q16695 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HIST3H3Q16695 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HIST3H3Q16695 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HIST3H3Q16695 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HIST3H3Q16695 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HIST3H3Q16695 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HIST3H3Q16695 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HIST3H3Q16695 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HIST3H3Q16695 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HIST3H3Q16695 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HIST3H3Q16695 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HIST3H3Q16695 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HIST3H3Q16695 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HIST3H3Q16695 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HIST3H3Q16695 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HIST3H3Q16695 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HIST3H3Q16695 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
HIST3H3Q16695 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
HIST3H3Q16695 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HIST3H3Q16695 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HIST3H3Q16695 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HIST3H3Q16695 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HIST3H3Q16695 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HIST3H3Q16695 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HIST3H3Q16695 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HIST3H3Q16695 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HIST3H3Q16695 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HIST3H3Q16695 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
HIST3H3Q16695 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
HIST3H3Q16695 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
HIST3H3Q16695 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
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