Protein–RNA interactions for Protein: Q16656

NRF1, Nuclear respiratory factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 503 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRF1Q16656 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
NRF1Q16656 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NRF1Q16656 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NRF1Q16656 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NRF1Q16656 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NRF1Q16656 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NRF1Q16656 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NRF1Q16656 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
NRF1Q16656 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
NRF1Q16656 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NRF1Q16656 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NRF1Q16656 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NRF1Q16656 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
NRF1Q16656 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
NRF1Q16656 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NRF1Q16656 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NRF1Q16656 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
NRF1Q16656 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
NRF1Q16656 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
NRF1Q16656 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
NRF1Q16656 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC19.25■□□□□ 0.67
NRF1Q16656 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
NRF1Q16656 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NRF1Q16656 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NRF1Q16656 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NRF1Q16656 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NRF1Q16656 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
NRF1Q16656 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NRF1Q16656 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
NRF1Q16656 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
NRF1Q16656 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NRF1Q16656 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
NRF1Q16656 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
NRF1Q16656 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
NRF1Q16656 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
NRF1Q16656 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
NRF1Q16656 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
NRF1Q16656 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
NRF1Q16656 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
NRF1Q16656 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
NRF1Q16656 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
NRF1Q16656 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
NRF1Q16656 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
NRF1Q16656 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
NRF1Q16656 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
NRF1Q16656 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
NRF1Q16656 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
NRF1Q16656 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
NRF1Q16656 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
NRF1Q16656 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
NRF1Q16656 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
NRF1Q16656 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
NRF1Q16656 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
NRF1Q16656 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
NRF1Q16656 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
NRF1Q16656 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
NRF1Q16656 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
NRF1Q16656 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
NRF1Q16656 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
NRF1Q16656 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
NRF1Q16656 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
NRF1Q16656 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
NRF1Q16656 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
NRF1Q16656 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
NRF1Q16656 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
NRF1Q16656 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
NRF1Q16656 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
NRF1Q16656 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
NRF1Q16656 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
NRF1Q16656 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
NRF1Q16656 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
NRF1Q16656 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
NRF1Q16656 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
NRF1Q16656 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
NRF1Q16656 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
NRF1Q16656 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
NRF1Q16656 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
NRF1Q16656 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
NRF1Q16656 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
NRF1Q16656 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
NRF1Q16656 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
NRF1Q16656 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
NRF1Q16656 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
NRF1Q16656 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
NRF1Q16656 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
NRF1Q16656 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
NRF1Q16656 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
NRF1Q16656 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
NRF1Q16656 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
NRF1Q16656 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
NRF1Q16656 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
NRF1Q16656 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
NRF1Q16656 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
NRF1Q16656 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
NRF1Q16656 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
NRF1Q16656 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
NRF1Q16656 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
NRF1Q16656 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
NRF1Q16656 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
NRF1Q16656 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms