Protein–RNA interactions for Protein: Q16586

SGCA, Alpha-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCAQ16586 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SGCAQ16586 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SGCAQ16586 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SGCAQ16586 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SGCAQ16586 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SGCAQ16586 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SGCAQ16586 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SGCAQ16586 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SGCAQ16586 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SGCAQ16586 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SGCAQ16586 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SGCAQ16586 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SGCAQ16586 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SGCAQ16586 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SGCAQ16586 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SGCAQ16586 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
SGCAQ16586 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SGCAQ16586 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SGCAQ16586 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
SGCAQ16586 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SGCAQ16586 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SGCAQ16586 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SGCAQ16586 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SGCAQ16586 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SGCAQ16586 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SGCAQ16586 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SGCAQ16586 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SGCAQ16586 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SGCAQ16586 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SGCAQ16586 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SGCAQ16586 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SGCAQ16586 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SGCAQ16586 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SGCAQ16586 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SGCAQ16586 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SGCAQ16586 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SGCAQ16586 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SGCAQ16586 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
SGCAQ16586 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SGCAQ16586 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SGCAQ16586 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SGCAQ16586 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SGCAQ16586 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SGCAQ16586 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SGCAQ16586 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SGCAQ16586 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SGCAQ16586 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SGCAQ16586 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SGCAQ16586 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
SGCAQ16586 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SGCAQ16586 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SGCAQ16586 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SGCAQ16586 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SGCAQ16586 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SGCAQ16586 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SGCAQ16586 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SGCAQ16586 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SGCAQ16586 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SGCAQ16586 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SGCAQ16586 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SGCAQ16586 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SGCAQ16586 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SGCAQ16586 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SGCAQ16586 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
SGCAQ16586 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SGCAQ16586 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SGCAQ16586 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SGCAQ16586 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
SGCAQ16586 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SGCAQ16586 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
SGCAQ16586 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SGCAQ16586 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SGCAQ16586 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SGCAQ16586 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SGCAQ16586 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SGCAQ16586 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SGCAQ16586 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SGCAQ16586 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SGCAQ16586 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SGCAQ16586 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SGCAQ16586 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SGCAQ16586 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SGCAQ16586 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
SGCAQ16586 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
SGCAQ16586 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SGCAQ16586 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SGCAQ16586 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SGCAQ16586 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SGCAQ16586 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SGCAQ16586 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SGCAQ16586 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SGCAQ16586 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SGCAQ16586 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SGCAQ16586 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SGCAQ16586 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SGCAQ16586 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SGCAQ16586 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SGCAQ16586 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SGCAQ16586 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SGCAQ16586 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms