Protein–RNA interactions for Protein: Q16512

PKN1, Serine/threonine-protein kinase N1, humanhuman

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Length 942 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKN1Q16512 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PKN1Q16512 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PKN1Q16512 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PKN1Q16512 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PKN1Q16512 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PKN1Q16512 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PKN1Q16512 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
PKN1Q16512 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PKN1Q16512 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PKN1Q16512 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PKN1Q16512 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PKN1Q16512 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PKN1Q16512 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PKN1Q16512 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PKN1Q16512 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PKN1Q16512 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PKN1Q16512 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PKN1Q16512 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PKN1Q16512 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PKN1Q16512 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PKN1Q16512 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PKN1Q16512 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PKN1Q16512 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
PKN1Q16512 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PKN1Q16512 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PKN1Q16512 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PKN1Q16512 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PKN1Q16512 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PKN1Q16512 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PKN1Q16512 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PKN1Q16512 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PKN1Q16512 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PKN1Q16512 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PKN1Q16512 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PKN1Q16512 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
PKN1Q16512 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PKN1Q16512 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PKN1Q16512 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PKN1Q16512 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PKN1Q16512 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PKN1Q16512 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PKN1Q16512 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PKN1Q16512 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
PKN1Q16512 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PKN1Q16512 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PKN1Q16512 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PKN1Q16512 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PKN1Q16512 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PKN1Q16512 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PKN1Q16512 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PKN1Q16512 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PKN1Q16512 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PKN1Q16512 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PKN1Q16512 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PKN1Q16512 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PKN1Q16512 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PKN1Q16512 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PKN1Q16512 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PKN1Q16512 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PKN1Q16512 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PKN1Q16512 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PKN1Q16512 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PKN1Q16512 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PKN1Q16512 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PKN1Q16512 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PKN1Q16512 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PKN1Q16512 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PKN1Q16512 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PKN1Q16512 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PKN1Q16512 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PKN1Q16512 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PKN1Q16512 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PKN1Q16512 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PKN1Q16512 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PKN1Q16512 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PKN1Q16512 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PKN1Q16512 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PKN1Q16512 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PKN1Q16512 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
PKN1Q16512 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PKN1Q16512 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PKN1Q16512 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PKN1Q16512 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PKN1Q16512 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PKN1Q16512 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PKN1Q16512 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
PKN1Q16512 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PKN1Q16512 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PKN1Q16512 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PKN1Q16512 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PKN1Q16512 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PKN1Q16512 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PKN1Q16512 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PKN1Q16512 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PKN1Q16512 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PKN1Q16512 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PKN1Q16512 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PKN1Q16512 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PKN1Q16512 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PKN1Q16512 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
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