Protein–RNA interactions for Protein: Q16378

PRR4, Proline-rich protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRR4Q16378 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
PRR4Q16378 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
PRR4Q16378 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
PRR4Q16378 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
PRR4Q16378 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
PRR4Q16378 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
PRR4Q16378 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
PRR4Q16378 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
PRR4Q16378 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
PRR4Q16378 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
PRR4Q16378 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
PRR4Q16378 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
PRR4Q16378 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
PRR4Q16378 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
PRR4Q16378 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
PRR4Q16378 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
PRR4Q16378 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
PRR4Q16378 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
PRR4Q16378 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
PRR4Q16378 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
PRR4Q16378 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
PRR4Q16378 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
PRR4Q16378 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
PRR4Q16378 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
PRR4Q16378 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
PRR4Q16378 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
PRR4Q16378 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
PRR4Q16378 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
PRR4Q16378 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
PRR4Q16378 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
PRR4Q16378 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
PRR4Q16378 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
PRR4Q16378 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
PRR4Q16378 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC12.29□□□□□ -0.44
PRR4Q16378 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
PRR4Q16378 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
PRR4Q16378 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
PRR4Q16378 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
PRR4Q16378 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
PRR4Q16378 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
PRR4Q16378 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
PRR4Q16378 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
PRR4Q16378 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
PRR4Q16378 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
PRR4Q16378 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
PRR4Q16378 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
PRR4Q16378 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
PRR4Q16378 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
PRR4Q16378 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
PRR4Q16378 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
PRR4Q16378 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
PRR4Q16378 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
PRR4Q16378 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
PRR4Q16378 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
PRR4Q16378 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
PRR4Q16378 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
PRR4Q16378 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
PRR4Q16378 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
PRR4Q16378 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
PRR4Q16378 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
PRR4Q16378 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
PRR4Q16378 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
PRR4Q16378 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
PRR4Q16378 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
PRR4Q16378 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
PRR4Q16378 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC12.28□□□□□ -0.44
PRR4Q16378 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
PRR4Q16378 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
PRR4Q16378 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
PRR4Q16378 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
PRR4Q16378 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
PRR4Q16378 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
PRR4Q16378 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
PRR4Q16378 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
PRR4Q16378 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
PRR4Q16378 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
PRR4Q16378 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
PRR4Q16378 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
PRR4Q16378 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
PRR4Q16378 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
PRR4Q16378 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
PRR4Q16378 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
PRR4Q16378 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
PRR4Q16378 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC12.28□□□□□ -0.44
PRR4Q16378 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
PRR4Q16378 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
PRR4Q16378 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
PRR4Q16378 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
PRR4Q16378 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
PRR4Q16378 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
PRR4Q16378 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
PRR4Q16378 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
PRR4Q16378 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
PRR4Q16378 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
PRR4Q16378 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
PRR4Q16378 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
PRR4Q16378 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
PRR4Q16378 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC12.27□□□□□ -0.44
PRR4Q16378 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
PRR4Q16378 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms