Protein–RNA interactions for Protein: Q16143

SNCB, Beta-synuclein, humanhuman

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Length 134 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNCBQ16143 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SNCBQ16143 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SNCBQ16143 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SNCBQ16143 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
SNCBQ16143 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SNCBQ16143 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SNCBQ16143 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SNCBQ16143 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
SNCBQ16143 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
SNCBQ16143 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SNCBQ16143 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SNCBQ16143 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
SNCBQ16143 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SNCBQ16143 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
SNCBQ16143 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SNCBQ16143 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SNCBQ16143 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SNCBQ16143 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SNCBQ16143 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SNCBQ16143 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SNCBQ16143 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SNCBQ16143 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SNCBQ16143 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SNCBQ16143 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SNCBQ16143 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SNCBQ16143 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SNCBQ16143 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SNCBQ16143 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SNCBQ16143 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SNCBQ16143 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SNCBQ16143 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SNCBQ16143 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SNCBQ16143 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SNCBQ16143 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SNCBQ16143 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SNCBQ16143 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SNCBQ16143 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SNCBQ16143 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SNCBQ16143 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SNCBQ16143 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SNCBQ16143 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
SNCBQ16143 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SNCBQ16143 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SNCBQ16143 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SNCBQ16143 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SNCBQ16143 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SNCBQ16143 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SNCBQ16143 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SNCBQ16143 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SNCBQ16143 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SNCBQ16143 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SNCBQ16143 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SNCBQ16143 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SNCBQ16143 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SNCBQ16143 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SNCBQ16143 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SNCBQ16143 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SNCBQ16143 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SNCBQ16143 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SNCBQ16143 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SNCBQ16143 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SNCBQ16143 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SNCBQ16143 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SNCBQ16143 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SNCBQ16143 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SNCBQ16143 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SNCBQ16143 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SNCBQ16143 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SNCBQ16143 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SNCBQ16143 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SNCBQ16143 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SNCBQ16143 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SNCBQ16143 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
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SNCBQ16143 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SNCBQ16143 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SNCBQ16143 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SNCBQ16143 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SNCBQ16143 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SNCBQ16143 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SNCBQ16143 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SNCBQ16143 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SNCBQ16143 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SNCBQ16143 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SNCBQ16143 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SNCBQ16143 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SNCBQ16143 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SNCBQ16143 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SNCBQ16143 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SNCBQ16143 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SNCBQ16143 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SNCBQ16143 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SNCBQ16143 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SNCBQ16143 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SNCBQ16143 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SNCBQ16143 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SNCBQ16143 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SNCBQ16143 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SNCBQ16143 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
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