Protein–RNA interactions for Protein: Q15629

TRAM1, Translocating chain-associated membrane protein 1, humanhuman

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Length 374 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAM1Q15629 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRAM1Q15629 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRAM1Q15629 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRAM1Q15629 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRAM1Q15629 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRAM1Q15629 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRAM1Q15629 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRAM1Q15629 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
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TRAM1Q15629 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRAM1Q15629 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRAM1Q15629 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRAM1Q15629 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRAM1Q15629 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRAM1Q15629 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRAM1Q15629 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRAM1Q15629 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRAM1Q15629 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRAM1Q15629 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRAM1Q15629 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
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TRAM1Q15629 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRAM1Q15629 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRAM1Q15629 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRAM1Q15629 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRAM1Q15629 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRAM1Q15629 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRAM1Q15629 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRAM1Q15629 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRAM1Q15629 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TRAM1Q15629 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TRAM1Q15629 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TRAM1Q15629 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TRAM1Q15629 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TRAM1Q15629 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TRAM1Q15629 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TRAM1Q15629 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TRAM1Q15629 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TRAM1Q15629 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
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TRAM1Q15629 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
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TRAM1Q15629 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
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TRAM1Q15629 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
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TRAM1Q15629 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
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TRAM1Q15629 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
TRAM1Q15629 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
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TRAM1Q15629 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRAM1Q15629 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRAM1Q15629 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRAM1Q15629 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRAM1Q15629 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
TRAM1Q15629 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRAM1Q15629 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
TRAM1Q15629 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRAM1Q15629 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRAM1Q15629 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRAM1Q15629 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRAM1Q15629 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRAM1Q15629 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
TRAM1Q15629 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRAM1Q15629 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRAM1Q15629 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRAM1Q15629 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRAM1Q15629 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRAM1Q15629 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
TRAM1Q15629 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
TRAM1Q15629 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRAM1Q15629 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
TRAM1Q15629 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRAM1Q15629 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
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