Protein–RNA interactions for Protein: Q15544

TAF11, Transcription initiation factor TFIID subunit 11, humanhuman

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Length 211 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF11Q15544 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TAF11Q15544 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TAF11Q15544 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TAF11Q15544 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TAF11Q15544 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TAF11Q15544 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
TAF11Q15544 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TAF11Q15544 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TAF11Q15544 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TAF11Q15544 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TAF11Q15544 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TAF11Q15544 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TAF11Q15544 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TAF11Q15544 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TAF11Q15544 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TAF11Q15544 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TAF11Q15544 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TAF11Q15544 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TAF11Q15544 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TAF11Q15544 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TAF11Q15544 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TAF11Q15544 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TAF11Q15544 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TAF11Q15544 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TAF11Q15544 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TAF11Q15544 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TAF11Q15544 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TAF11Q15544 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
TAF11Q15544 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TAF11Q15544 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TAF11Q15544 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TAF11Q15544 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TAF11Q15544 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TAF11Q15544 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TAF11Q15544 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TAF11Q15544 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TAF11Q15544 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TAF11Q15544 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TAF11Q15544 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TAF11Q15544 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TAF11Q15544 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TAF11Q15544 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TAF11Q15544 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TAF11Q15544 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
TAF11Q15544 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TAF11Q15544 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC19.55■□□□□ 0.72
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TAF11Q15544 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TAF11Q15544 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TAF11Q15544 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TAF11Q15544 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TAF11Q15544 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TAF11Q15544 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TAF11Q15544 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TAF11Q15544 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
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TAF11Q15544 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TAF11Q15544 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TAF11Q15544 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TAF11Q15544 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TAF11Q15544 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TAF11Q15544 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
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TAF11Q15544 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TAF11Q15544 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TAF11Q15544 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TAF11Q15544 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TAF11Q15544 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
TAF11Q15544 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TAF11Q15544 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TAF11Q15544 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TAF11Q15544 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TAF11Q15544 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TAF11Q15544 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TAF11Q15544 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
TAF11Q15544 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TAF11Q15544 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TAF11Q15544 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TAF11Q15544 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TAF11Q15544 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TAF11Q15544 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TAF11Q15544 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TAF11Q15544 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
TAF11Q15544 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
TAF11Q15544 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms