Protein–RNA interactions for Protein: Q15431

SYCP1, Synaptonemal complex protein 1, humanhuman

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Length 976 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP1Q15431 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SYCP1Q15431 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SYCP1Q15431 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SYCP1Q15431 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SYCP1Q15431 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SYCP1Q15431 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SYCP1Q15431 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SYCP1Q15431 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SYCP1Q15431 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SYCP1Q15431 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SYCP1Q15431 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SYCP1Q15431 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SYCP1Q15431 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SYCP1Q15431 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SYCP1Q15431 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SYCP1Q15431 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SYCP1Q15431 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SYCP1Q15431 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SYCP1Q15431 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SYCP1Q15431 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SYCP1Q15431 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SYCP1Q15431 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SYCP1Q15431 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SYCP1Q15431 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SYCP1Q15431 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SYCP1Q15431 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SYCP1Q15431 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SYCP1Q15431 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SYCP1Q15431 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SYCP1Q15431 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SYCP1Q15431 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SYCP1Q15431 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SYCP1Q15431 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SYCP1Q15431 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SYCP1Q15431 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
SYCP1Q15431 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
SYCP1Q15431 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SYCP1Q15431 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SYCP1Q15431 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SYCP1Q15431 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SYCP1Q15431 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SYCP1Q15431 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SYCP1Q15431 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SYCP1Q15431 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
SYCP1Q15431 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SYCP1Q15431 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SYCP1Q15431 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SYCP1Q15431 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SYCP1Q15431 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SYCP1Q15431 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SYCP1Q15431 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SYCP1Q15431 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SYCP1Q15431 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SYCP1Q15431 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SYCP1Q15431 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SYCP1Q15431 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SYCP1Q15431 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SYCP1Q15431 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SYCP1Q15431 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SYCP1Q15431 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SYCP1Q15431 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SYCP1Q15431 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SYCP1Q15431 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SYCP1Q15431 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SYCP1Q15431 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SYCP1Q15431 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SYCP1Q15431 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SYCP1Q15431 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SYCP1Q15431 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SYCP1Q15431 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SYCP1Q15431 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SYCP1Q15431 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SYCP1Q15431 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SYCP1Q15431 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SYCP1Q15431 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SYCP1Q15431 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SYCP1Q15431 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SYCP1Q15431 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SYCP1Q15431 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SYCP1Q15431 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SYCP1Q15431 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SYCP1Q15431 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SYCP1Q15431 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SYCP1Q15431 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SYCP1Q15431 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
SYCP1Q15431 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SYCP1Q15431 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SYCP1Q15431 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SYCP1Q15431 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SYCP1Q15431 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SYCP1Q15431 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SYCP1Q15431 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SYCP1Q15431 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SYCP1Q15431 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SYCP1Q15431 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SYCP1Q15431 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SYCP1Q15431 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SYCP1Q15431 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SYCP1Q15431 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SYCP1Q15431 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
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