Protein–RNA interactions for Protein: Q15427

SF3B4, Splicing factor 3B subunit 4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 424 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B4Q15427 DNAJC2-211ENST00000492497 2167 ntTSL 29.46□□□□□ -0.892e-7■■■■■ 35.3
SF3B4Q15427 TPM4-216ENST00000592822 262 ntTSL 58.93□□□□□ -0.982e-7■■■■■ 35.3
SF3B4Q15427 SNF8-214ENST00000515174 823 ntTSL 28.91□□□□□ -0.982e-7■■■■■ 35.3
SF3B4Q15427 EIF3K-212ENST00000593062 704 ntTSL 28.71□□□□□ -1.022e-7■■■■■ 35.3
SF3B4Q15427 RHOBTB1-202ENST00000357917 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.56□□□□□ -1.042e-7■■■■■ 35.3
SF3B4Q15427 SNF8-211ENST00000512243 863 ntTSL 28.44□□□□□ -1.062e-7■■■■■ 35.3
SF3B4Q15427 RNF10-215ENST00000542207 548 ntTSL 48.12□□□□□ -1.112e-7■■■■■ 35.3
SF3B4Q15427 MCCC1-213ENST00000497959 2874 ntTSL 28.03□□□□□ -1.122e-7■■■■■ 35.3
SF3B4Q15427 GABRE-210ENST00000489333 592 ntTSL 27.94□□□□□ -1.142e-7■■■■■ 35.3
SF3B4Q15427 RHOBTB1-203ENST00000461910 447 ntTSL 27.27□□□□□ -1.252e-7■■■■■ 35.3
SF3B4Q15427 MED15P8-201ENST00000411601 545 ntBASIC7.17□□□□□ -1.262e-7■■■■■ 35.3
SF3B4Q15427 MCCC1-210ENST00000492597 2774 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.282e-7■■■■■ 35.3
SF3B4Q15427 LIN9-205ENST00000481685 1916 ntTSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.292e-7■■■■■ 35.3
SF3B4Q15427 RHOBTB1-205ENST00000490827 518 ntTSL 36.41□□□□□ -1.382e-7■■■■■ 35.3
SF3B4Q15427 EPRS-205ENST00000485821 598 ntTSL 35.18□□□□□ -1.582e-7■■■■■ 35.3
SF3B4Q15427 LIN9-204ENST00000460719 2909 ntTSL 1 (best)3.74□□□□□ -1.812e-7■■■■■ 35.3
SF3B4Q15427 TPM4-214ENST00000591645 653 ntTSL 33.66□□□□□ -1.822e-7■■■■■ 35.3
SF3B4Q15427 DAPK1-203ENST00000463069 327 ntTSL 43.56□□□□□ -1.842e-7■■■■■ 35.3
SF3B4Q15427 MCCC1-208ENST00000489909 458 ntTSL 33.52□□□□□ -1.852e-7■■■■■ 35.3
SF3B4Q15427 RNU2-27P-201ENST00000516185 142 ntBASIC3.23□□□□□ -1.892e-7■■■■■ 35.3
SF3B4Q15427 IARS-207ENST00000467876 298 ntTSL 32.8□□□□□ -1.962e-7■■■■■ 35.3
SF3B4Q15427 POLA1-201ENST00000379059 5440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.252e-6■■■■■ 35.2
SF3B4Q15427 POLA1-206ENST00000611764 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.252e-6■■■■■ 35.2
SF3B4Q15427 POLA1-202ENST00000379068 5486 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.272e-6■■■■■ 35.2
SF3B4Q15427 TRMT2A-218ENST00000492988 854 ntTSL 515.35■□□□□ 0.056e-7■■■■■ 35.2
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SF3B4Q15427 RPS16-201ENST00000251453 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.684e-8■■■■■ 35.2
SF3B4Q15427 RPS16-206ENST00000601390 2389 ntTSL 29.94□□□□□ -0.824e-8■■■■■ 35.2
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SF3B4Q15427 RPS16-204ENST00000599539 555 ntTSL 2 BASIC8.84□□□□□ -0.994e-8■■■■■ 35.2
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SF3B4Q15427 ANKRD11-203ENST00000378330 9132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.357e-8■■■■■ 35.2
SF3B4Q15427 ESYT1-208ENST00000550986 543 ntTSL 49.02□□□□□ -0.971e-8■■■■■ 35.2
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SF3B4Q15427 TMEM181-201ENST00000367090 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.212e-7■■■■■ 35.2
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SF3B4Q15427 FLNA-201ENST00000344736 7932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.334e-7■■■■■ 35.2
SF3B4Q15427 FLNA-206ENST00000420627 8225 ntTSL 512.54□□□□□ -0.44e-7■■■■■ 35.2
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SF3B4Q15427 PCM1-201ENST00000325083 6820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.292e-10■■■■■ 35.2
SF3B4Q15427 PCM1-202ENST00000327578 8287 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.352e-10■■■■■ 35.2
SF3B4Q15427 AKAP8-204ENST00000598597 3071 ntTSL 1 (best)12.83□□□□□ -0.362e-10■■■■■ 35.2
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SF3B4Q15427 EIF3K-210ENST00000591409 583 ntTSL 312.04□□□□□ -0.482e-10■■■■■ 35.2
SF3B4Q15427 CNOT1-220ENST00000569916 599 ntTSL 311.8□□□□□ -0.522e-10■■■■■ 35.2
SF3B4Q15427 CNOT1-217ENST00000569263 304 ntTSL 211.79□□□□□ -0.522e-10■■■■■ 35.2
SF3B4Q15427 CNOT1-213ENST00000568158 496 ntTSL 311.72□□□□□ -0.532e-10■■■■■ 35.2
SF3B4Q15427 ZNF655-209ENST00000422422 782 ntTSL 311.48□□□□□ -0.573e-13■■■■■ 35.2
SF3B4Q15427 EIF3K-213ENST00000593149 760 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.652e-10■■■■■ 35.2
SF3B4Q15427 ZNF655-204ENST00000394163 4528 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.692e-10■■■■■ 35.2
SF3B4Q15427 EIF3K-214ENST00000614624 780 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.842e-10■■■■■ 35.2
SF3B4Q15427 EIF3K-208ENST00000588934 501 ntTSL 3 BASIC9.26□□□□□ -0.932e-10■■■■■ 35.2
SF3B4Q15427 CNOT1-208ENST00000565697 385 ntTSL 39.07□□□□□ -0.962e-10■■■■■ 35.2
SF3B4Q15427 EIF3K-201ENST00000248342 864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.982e-10■■■■■ 35.2
SF3B4Q15427 CNOT1-207ENST00000565605 739 ntTSL 48.74□□□□□ -1.012e-10■■■■■ 35.2
SF3B4Q15427 EIF3K-211ENST00000592558 670 ntTSL 2 BASIC8.71□□□□□ -1.022e-10■■■■■ 35.2
SF3B4Q15427 PCM1-212ENST00000519253 6443 ntTSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.092e-10■■■■■ 35.2
SF3B4Q15427 EIF3K-206ENST00000588299 524 ntTSL 28.19□□□□□ -1.12e-10■■■■■ 35.2
SF3B4Q15427 EIF3K-209ENST00000590134 711 ntTSL 27.93□□□□□ -1.142e-10■■■■■ 35.2
SF3B4Q15427 ZNF655-213ENST00000425063 4624 ntTSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.222e-10■■■■■ 35.2
SF3B4Q15427 ZNF655-222ENST00000493277 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.252e-10■■■■■ 35.2
SF3B4Q15427 TAF1D-206ENST00000527068 1023 ntTSL 56.01□□□□□ -1.459e-17■■■■■ 35.2
SF3B4Q15427 PCM1-222ENST00000524226 5955 ntTSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -22e-10■■■■■ 35.2
SF3B4Q15427 PACSIN2-212ENST00000634914 1431 ntTSL 510.9□□□□□ -0.668e-18■■■■■ 35.2
SF3B4Q15427 AC132008.2-202ENST00000414207 1286 ntTSL 519.14■□□□□ 0.652e-7■■■■■ 35.2
SF3B4Q15427 AC132008.2-201ENST00000453454 956 ntTSL 4 BASIC10.65□□□□□ -0.72e-7■■■■■ 35.2
SF3B4Q15427 RBM25-205ENST00000527432 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.936e-7■■■■■ 35.2
SF3B4Q15427 RBM25-201ENST00000261973 6910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.316e-7■■■■■ 35.2
SF3B4Q15427 RBM25-207ENST00000528081 3008 ntTSL 25.41□□□□□ -1.546e-7■■■■■ 35.2
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