Protein–RNA interactions for Protein: Q15417

CNN3, Calponin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 329 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNN3Q15417 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CNN3Q15417 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CNN3Q15417 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CNN3Q15417 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CNN3Q15417 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CNN3Q15417 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CNN3Q15417 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CNN3Q15417 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CNN3Q15417 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CNN3Q15417 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CNN3Q15417 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CNN3Q15417 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CNN3Q15417 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CNN3Q15417 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CNN3Q15417 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CNN3Q15417 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CNN3Q15417 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CNN3Q15417 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CNN3Q15417 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CNN3Q15417 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CNN3Q15417 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CNN3Q15417 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CNN3Q15417 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CNN3Q15417 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CNN3Q15417 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CNN3Q15417 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CNN3Q15417 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CNN3Q15417 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CNN3Q15417 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CNN3Q15417 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CNN3Q15417 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CNN3Q15417 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CNN3Q15417 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CNN3Q15417 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CNN3Q15417 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CNN3Q15417 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CNN3Q15417 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CNN3Q15417 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CNN3Q15417 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CNN3Q15417 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CNN3Q15417 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CNN3Q15417 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CNN3Q15417 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CNN3Q15417 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CNN3Q15417 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CNN3Q15417 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CNN3Q15417 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CNN3Q15417 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CNN3Q15417 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CNN3Q15417 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CNN3Q15417 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CNN3Q15417 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CNN3Q15417 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CNN3Q15417 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CNN3Q15417 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CNN3Q15417 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
CNN3Q15417 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CNN3Q15417 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CNN3Q15417 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CNN3Q15417 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
CNN3Q15417 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
CNN3Q15417 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
CNN3Q15417 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
CNN3Q15417 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CNN3Q15417 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
CNN3Q15417 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CNN3Q15417 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CNN3Q15417 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
CNN3Q15417 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CNN3Q15417 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CNN3Q15417 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CNN3Q15417 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CNN3Q15417 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
CNN3Q15417 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CNN3Q15417 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
CNN3Q15417 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CNN3Q15417 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CNN3Q15417 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CNN3Q15417 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CNN3Q15417 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CNN3Q15417 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CNN3Q15417 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CNN3Q15417 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CNN3Q15417 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CNN3Q15417 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CNN3Q15417 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CNN3Q15417 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CNN3Q15417 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CNN3Q15417 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CNN3Q15417 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CNN3Q15417 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CNN3Q15417 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CNN3Q15417 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CNN3Q15417 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
CNN3Q15417 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CNN3Q15417 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CNN3Q15417 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CNN3Q15417 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CNN3Q15417 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CNN3Q15417 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
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