Protein–RNA interactions for Protein: Q15413

RYR3, Ryanodine receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 4,870 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RYR3Q15413 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
RYR3Q15413 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
RYR3Q15413 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
RYR3Q15413 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
RYR3Q15413 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
RYR3Q15413 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
RYR3Q15413 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
RYR3Q15413 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
RYR3Q15413 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
RYR3Q15413 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
RYR3Q15413 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
RYR3Q15413 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
RYR3Q15413 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
RYR3Q15413 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
RYR3Q15413 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
RYR3Q15413 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
RYR3Q15413 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
RYR3Q15413 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
RYR3Q15413 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC13.73□□□□□ -0.21
RYR3Q15413 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
RYR3Q15413 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
RYR3Q15413 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
RYR3Q15413 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
RYR3Q15413 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
RYR3Q15413 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
RYR3Q15413 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
RYR3Q15413 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
RYR3Q15413 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
RYR3Q15413 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
RYR3Q15413 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RYR3Q15413 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
RYR3Q15413 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RYR3Q15413 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RYR3Q15413 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RYR3Q15413 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RYR3Q15413 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
RYR3Q15413 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
RYR3Q15413 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
RYR3Q15413 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
RYR3Q15413 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RYR3Q15413 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RYR3Q15413 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RYR3Q15413 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
RYR3Q15413 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
RYR3Q15413 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
RYR3Q15413 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
RYR3Q15413 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RYR3Q15413 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RYR3Q15413 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RYR3Q15413 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
RYR3Q15413 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
RYR3Q15413 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
RYR3Q15413 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RYR3Q15413 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RYR3Q15413 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
RYR3Q15413 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
RYR3Q15413 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RYR3Q15413 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RYR3Q15413 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RYR3Q15413 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RYR3Q15413 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RYR3Q15413 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
RYR3Q15413 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
RYR3Q15413 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
RYR3Q15413 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
RYR3Q15413 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
RYR3Q15413 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
RYR3Q15413 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
RYR3Q15413 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
RYR3Q15413 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
RYR3Q15413 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
RYR3Q15413 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
RYR3Q15413 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
RYR3Q15413 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
RYR3Q15413 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
RYR3Q15413 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
RYR3Q15413 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
RYR3Q15413 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC13.71□□□□□ -0.22
RYR3Q15413 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
RYR3Q15413 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RYR3Q15413 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
RYR3Q15413 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
RYR3Q15413 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
RYR3Q15413 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
RYR3Q15413 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
RYR3Q15413 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RYR3Q15413 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
RYR3Q15413 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC13.7□□□□□ -0.22
RYR3Q15413 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RYR3Q15413 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RYR3Q15413 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RYR3Q15413 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RYR3Q15413 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RYR3Q15413 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
RYR3Q15413 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
RYR3Q15413 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RYR3Q15413 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RYR3Q15413 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
RYR3Q15413 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
RYR3Q15413 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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