Protein–RNA interactions for Protein: Q15397

PUM3, Pumilio homolog 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 648 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUM3Q15397 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PUM3Q15397 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PUM3Q15397 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PUM3Q15397 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PUM3Q15397 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
PUM3Q15397 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PUM3Q15397 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PUM3Q15397 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PUM3Q15397 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PUM3Q15397 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PUM3Q15397 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PUM3Q15397 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PUM3Q15397 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PUM3Q15397 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PUM3Q15397 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
PUM3Q15397 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PUM3Q15397 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PUM3Q15397 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PUM3Q15397 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PUM3Q15397 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
PUM3Q15397 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
PUM3Q15397 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
PUM3Q15397 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
PUM3Q15397 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
PUM3Q15397 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
PUM3Q15397 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
PUM3Q15397 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PUM3Q15397 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PUM3Q15397 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PUM3Q15397 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PUM3Q15397 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PUM3Q15397 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PUM3Q15397 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PUM3Q15397 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PUM3Q15397 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PUM3Q15397 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PUM3Q15397 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PUM3Q15397 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PUM3Q15397 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PUM3Q15397 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PUM3Q15397 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PUM3Q15397 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PUM3Q15397 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PUM3Q15397 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PUM3Q15397 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PUM3Q15397 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PUM3Q15397 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PUM3Q15397 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PUM3Q15397 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PUM3Q15397 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PUM3Q15397 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PUM3Q15397 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PUM3Q15397 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PUM3Q15397 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PUM3Q15397 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PUM3Q15397 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PUM3Q15397 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PUM3Q15397 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PUM3Q15397 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PUM3Q15397 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PUM3Q15397 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PUM3Q15397 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PUM3Q15397 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PUM3Q15397 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PUM3Q15397 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PUM3Q15397 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PUM3Q15397 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PUM3Q15397 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
PUM3Q15397 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PUM3Q15397 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PUM3Q15397 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PUM3Q15397 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PUM3Q15397 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PUM3Q15397 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PUM3Q15397 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PUM3Q15397 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PUM3Q15397 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PUM3Q15397 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PUM3Q15397 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PUM3Q15397 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PUM3Q15397 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PUM3Q15397 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
PUM3Q15397 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PUM3Q15397 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PUM3Q15397 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PUM3Q15397 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
PUM3Q15397 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
PUM3Q15397 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
PUM3Q15397 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PUM3Q15397 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PUM3Q15397 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PUM3Q15397 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PUM3Q15397 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PUM3Q15397 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PUM3Q15397 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PUM3Q15397 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PUM3Q15397 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PUM3Q15397 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PUM3Q15397 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PUM3Q15397 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
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