Protein–RNA interactions for Protein: Q15365

PCBP1, Poly(rC)-binding protein 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCBP1Q15365 GTPBP1-206ENST00000462332 3035 ntTSL 211.47□□□□□ -0.572e-12■■■■□ 19.3
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PCBP1Q15365 AC008878.1-202ENST00000599312 382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.61e-6■■■■□ 19.3
PCBP1Q15365 MYO18A-209ENST00000531253 7504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.631e-6■■■■□ 19.3
PCBP1Q15365 MYO18A-223ENST00000628822 7501 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.631e-6■■■■□ 19.3
PCBP1Q15365 PLSCR4-201ENST00000354952 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.651e-6■■■■□ 19.3
PCBP1Q15365 KIAA1671-201ENST00000358431 10490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.691e-6■■■■□ 19.3
PCBP1Q15365 PLSCR4-211ENST00000498625 593 ntTSL 410.73□□□□□ -0.691e-6■■■■□ 19.3
PCBP1Q15365 MYO18A-214ENST00000533112 7522 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.71e-6■■■■□ 19.3
PCBP1Q15365 KIAA1671-205ENST00000494730 6082 ntTSL 1 (best)10.25□□□□□ -0.771e-6■■■■□ 19.3
PCBP1Q15365 PLSCR4-210ENST00000493382 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.781e-6■■■■□ 19.3
PCBP1Q15365 KIAA1671-203ENST00000406486 7864 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.81e-6■■■■□ 19.3
PCBP1Q15365 PLSCR4-209ENST00000481701 683 ntTSL 49.95□□□□□ -0.821e-6■■■■□ 19.3
PCBP1Q15365 ANKRD11-215ENST00000568512 294 ntTSL 29.79□□□□□ -0.842e-10■■■■□ 19.3
PCBP1Q15365 ATXN1L-201ENST00000427980 7886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.851e-6■■■■□ 19.3
PCBP1Q15365 UBE2D2-207ENST00000511691 543 ntTSL 28.44□□□□□ -1.066e-7■■■■□ 19.3
PCBP1Q15365 FOXN3-206ENST00000554005 450 ntTSL 57.33□□□□□ -1.241e-6■■■■□ 19.3
PCBP1Q15365 MREG-202ENST00000420348 584 ntTSL 46.72□□□□□ -1.331e-6■■■■□ 19.3
PCBP1Q15365 MREG-203ENST00000424992 560 ntTSL 56.64□□□□□ -1.351e-6■■■■□ 19.3
PCBP1Q15365 FOXN3-218ENST00000557718 398 ntTSL 56.43□□□□□ -1.381e-6■■■■□ 19.3
PCBP1Q15365 MREG-204ENST00000439791 576 ntTSL 46.25□□□□□ -1.411e-6■■■■□ 19.3
PCBP1Q15365 PLSCR4-206ENST00000460885 609 ntTSL 35.84□□□□□ -1.471e-6■■■■□ 19.3
PCBP1Q15365 PLSCR4-207ENST00000475019 807 ntTSL 35.78□□□□□ -1.481e-6■■■■□ 19.3
PCBP1Q15365 UBE2D2-201ENST00000253815 444 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.576e-7■■■■□ 19.3
PCBP1Q15365 FOXN3-213ENST00000556916 467 ntTSL 34.71□□□□□ -1.661e-6■■■■□ 19.3
PCBP1Q15365 FOXN3-203ENST00000553353 366 ntTSL 33.6□□□□□ -1.831e-6■■■■□ 19.3
PCBP1Q15365 PLXNB2-210ENST00000479818 1916 ntTSL 1 (best)18.8■□□□□ 0.62e-6■■■■□ 19.3
PCBP1Q15365 PLXNB2-207ENST00000449103 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.172e-6■■■■□ 19.3
PCBP1Q15365 PLXNB2-201ENST00000359337 6335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.222e-6■■■■□ 19.3
PCBP1Q15365 PLXNB2-209ENST00000479701 3504 ntTSL 213.54□□□□□ -0.242e-6■■■■□ 19.3
PCBP1Q15365 PLXNB2-208ENST00000463165 3038 ntTSL 212.51□□□□□ -0.412e-6■■■■□ 19.3
PCBP1Q15365 PLXNB2-213ENST00000610984 3443 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.682e-6■■■■□ 19.3
PCBP1Q15365 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.577e-7■■■■□ 19.3
PCBP1Q15365 MSH5-SAPCD1-206ENST00000491552 706 ntTSL 318.02■□□□□ 0.483e-7■■■■□ 19.3
PCBP1Q15365 MSH5-208ENST00000429846 616 ntTSL 316.65■□□□□ 0.263e-7■■■■□ 19.3
PCBP1Q15365 MSH5-216ENST00000484309 857 ntTSL 513.57□□□□□ -0.243e-7■■■■□ 19.3
PCBP1Q15365 MSH5-217ENST00000494458 520 ntTSL 27.39□□□□□ -1.233e-7■■■■□ 19.3
PCBP1Q15365 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC30.92■■■□□ 2.541e-7■■■■□ 19.3
PCBP1Q15365 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.141e-7■■■■□ 19.3
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PCBP1Q15365 MAZ-209ENST00000565777 1313 ntTSL 218.42■□□□□ 0.541e-7■■■■□ 19.3
PCBP1Q15365 MAZ-213ENST00000568411 599 ntTSL 317.01■□□□□ 0.311e-7■■■■□ 19.3
PCBP1Q15365 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.567e-7■■■■□ 19.3
PCBP1Q15365 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.37e-7■■■■□ 19.3
PCBP1Q15365 PROX1-204ENST00000471129 900 ntTSL 319.11■□□□□ 0.654e-11■■■□□ 19.2
PCBP1Q15365 PROX1-207ENST00000607726 562 ntTSL 415.49■□□□□ 0.074e-11■■■□□ 19.2
PCBP1Q15365 PROX1-202ENST00000366958 8240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.184e-11■■■□□ 19.2
PCBP1Q15365 PROX1-205ENST00000498508 8498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.484e-11■■■□□ 19.2
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PCBP1Q15365 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.442e-8■■■□□ 19.2
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PCBP1Q15365 PKM-202ENST00000335181 2318 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.422e-8■■■□□ 19.2
PCBP1Q15365 PKM-219ENST00000567118 2254 ntTSL 212.03□□□□□ -0.482e-8■■■□□ 19.2
PCBP1Q15365 PKM-212ENST00000564440 3016 ntTSL 1 (best)9.66□□□□□ -0.862e-8■■■□□ 19.2
PCBP1Q15365 FAM53C-204ENST00000505768 772 ntTSL 321.3■■□□□ 13e-9■■■□□ 19.2
PCBP1Q15365 FAM53C-203ENST00000505136 717 ntTSL 519.85■□□□□ 0.773e-9■■■□□ 19.2
PCBP1Q15365 ANKRD11-205ENST00000562194 618 ntTSL 317.95■□□□□ 0.464e-23■■■□□ 19.2
PCBP1Q15365 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.979e-7■■■□□ 19.2
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PCBP1Q15365 FCGRT-208ENST00000595881 2681 ntTSL 219.7■□□□□ 0.749e-7■■■□□ 19.2
PCBP1Q15365 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.719e-7■■■□□ 19.2
PCBP1Q15365 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.659e-7■■■□□ 19.2
PCBP1Q15365 SPRED2-205ENST00000440972 555 ntTSL 314.46□□□□□ -0.097e-15■■■□□ 19.2
PCBP1Q15365 MICALL2-202ENST00000413446 3046 ntTSL 213.82□□□□□ -0.22e-6■■■□□ 19.2
PCBP1Q15365 SEMA4C-202ENST00000442264 817 ntTSL 322.74■■□□□ 1.232e-6■■■□□ 19.2
PCBP1Q15365 LSM2-209ENST00000470083 641 ntTSL 213.39□□□□□ -0.272e-6■■■□□ 19.2
PCBP1Q15365 TOX3-203ENST00000563091 572 ntTSL 49.63□□□□□ -0.875e-11■■■□□ 19.2
PCBP1Q15365 TOX3-202ENST00000407228 3124 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.58□□□□□ -1.365e-11■■■□□ 19.2
PCBP1Q15365 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.452e-10■■■□□ 19.2
PCBP1Q15365 NINJ1-204ENST00000489274 2026 ntTSL 215.51■□□□□ 0.072e-10■■■□□ 19.2
PCBP1Q15365 NINJ1-203ENST00000470314 834 ntTSL 314.63□□□□□ -0.072e-10■■■□□ 19.2
PCBP1Q15365 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.766e-10■■■□□ 19.2
PCBP1Q15365 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.616e-10■■■□□ 19.2
PCBP1Q15365 SLC25A1-205ENST00000470922 1598 ntTSL 224.82■■□□□ 1.566e-10■■■□□ 19.2
PCBP1Q15365 TXN2-201ENST00000216185 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.266e-7■■■□□ 19.2
PCBP1Q15365 TXN2-204ENST00000416967 1280 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.276e-7■■■□□ 19.2
PCBP1Q15365 JUND-202ENST00000600972 500 ntTSL 228.2■■■□□ 2.14e-7■■■□□ 19.2
PCBP1Q15365 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.821e-7■■■□□ 19.2
PCBP1Q15365 AKR1A1-208ENST00000476957 910 ntTSL 319.17■□□□□ 0.661e-7■■■□□ 19.2
PCBP1Q15365 AKR1A1-212ENST00000496999 775 ntTSL 218.63■□□□□ 0.571e-7■■■□□ 19.2
PCBP1Q15365 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.161e-7■■■□□ 19.2
PCBP1Q15365 AKR1A1-203ENST00000434299 840 ntTSL 215.5■□□□□ 0.071e-7■■■□□ 19.2
PCBP1Q15365 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.477e-9■■■□□ 19.2
PCBP1Q15365 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.277e-9■■■□□ 19.2
PCBP1Q15365 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.267e-9■■■□□ 19.2
PCBP1Q15365 C16orf58-210ENST00000568491 2422 ntTSL 215.13■□□□□ 0.017e-9■■■□□ 19.2
PCBP1Q15365 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.813e-7■■■□□ 19.2
PCBP1Q15365 IRAK1-201ENST00000369973 2358 ntTSL 524.78■■□□□ 1.563e-7■■■□□ 19.2
PCBP1Q15365 IRAK1-208ENST00000444230 1125 ntTSL 519.28■□□□□ 0.683e-7■■■□□ 19.2
PCBP1Q15365 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.413e-7■■■□□ 19.2
PCBP1Q15365 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.033e-7■■■□□ 19.2
PCBP1Q15365 IRAK1-202ENST00000369974 3319 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.373e-7■■■□□ 19.2
PCBP1Q15365 CD7-203ENST00000581434 572 ntTSL 322.76■■□□□ 1.237e-9■■■□□ 19.1
PCBP1Q15365 CD7-204ENST00000581744 990 ntTSL 219.99■□□□□ 0.797e-9■■■□□ 19.1
PCBP1Q15365 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.547e-9■■■□□ 19.1
PCBP1Q15365 GANAB-216ENST00000540933 3836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.645e-7■■■□□ 19.1
PCBP1Q15365 GANAB-201ENST00000346178 3906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.685e-7■■■□□ 19.1
PCBP1Q15365 GANAB-211ENST00000532402 3718 ntTSL 1 (best)10.37□□□□□ -0.755e-7■■■□□ 19.1
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