Protein–RNA interactions for Protein: Q15262

PTPRK, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, humanhuman

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Length 1,439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRKQ15262 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
PTPRKQ15262 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.63■■■□□ 2.49
PTPRKQ15262 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.63■■■□□ 2.49
PTPRKQ15262 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
PTPRKQ15262 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
PTPRKQ15262 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
PTPRKQ15262 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC30.63■■■□□ 2.49
PTPRKQ15262 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
PTPRKQ15262 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
PTPRKQ15262 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC30.63■■■□□ 2.49
PTPRKQ15262 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC30.63■■■□□ 2.49
PTPRKQ15262 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
PTPRKQ15262 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
PTPRKQ15262 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.62■■■□□ 2.49
PTPRKQ15262 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC30.62■■■□□ 2.49
PTPRKQ15262 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC30.62■■■□□ 2.49
PTPRKQ15262 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
PTPRKQ15262 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC30.62■■■□□ 2.49
PTPRKQ15262 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
PTPRKQ15262 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC30.62■■■□□ 2.49
PTPRKQ15262 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
PTPRKQ15262 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC30.62■■■□□ 2.49
PTPRKQ15262 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
PTPRKQ15262 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC30.62■■■□□ 2.49
PTPRKQ15262 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
PTPRKQ15262 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC30.61■■■□□ 2.49
PTPRKQ15262 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC30.61■■■□□ 2.49
PTPRKQ15262 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC30.61■■■□□ 2.49
PTPRKQ15262 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC30.61■■■□□ 2.49
PTPRKQ15262 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC30.61■■■□□ 2.49
PTPRKQ15262 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
PTPRKQ15262 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
PTPRKQ15262 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
PTPRKQ15262 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC30.6■■■□□ 2.49
PTPRKQ15262 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC30.6■■■□□ 2.49
PTPRKQ15262 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
PTPRKQ15262 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
PTPRKQ15262 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC30.6■■■□□ 2.49
PTPRKQ15262 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC30.6■■■□□ 2.49
PTPRKQ15262 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
PTPRKQ15262 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
PTPRKQ15262 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC30.6■■■□□ 2.49
PTPRKQ15262 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.6■■■□□ 2.49
PTPRKQ15262 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
PTPRKQ15262 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
PTPRKQ15262 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.6■■■□□ 2.49
PTPRKQ15262 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
PTPRKQ15262 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
PTPRKQ15262 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC30.59■■■□□ 2.49
PTPRKQ15262 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
PTPRKQ15262 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
PTPRKQ15262 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC30.59■■■□□ 2.49
PTPRKQ15262 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC30.59■■■□□ 2.49
PTPRKQ15262 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC30.59■■■□□ 2.49
PTPRKQ15262 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC30.59■■■□□ 2.49
PTPRKQ15262 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC30.59■■■□□ 2.49
PTPRKQ15262 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
PTPRKQ15262 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC30.59■■■□□ 2.49
PTPRKQ15262 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC30.59■■■□□ 2.49
PTPRKQ15262 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
PTPRKQ15262 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC30.58■■■□□ 2.49
PTPRKQ15262 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC30.58■■■□□ 2.49
PTPRKQ15262 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC30.58■■■□□ 2.49
PTPRKQ15262 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC30.58■■■□□ 2.49
PTPRKQ15262 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
PTPRKQ15262 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
PTPRKQ15262 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC30.58■■■□□ 2.49
PTPRKQ15262 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
PTPRKQ15262 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
PTPRKQ15262 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC30.57■■■□□ 2.48
PTPRKQ15262 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC30.57■■■□□ 2.48
PTPRKQ15262 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC30.57■■■□□ 2.48
PTPRKQ15262 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
PTPRKQ15262 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC30.57■■■□□ 2.48
PTPRKQ15262 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.57■■■□□ 2.48
PTPRKQ15262 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC30.57■■■□□ 2.48
PTPRKQ15262 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC30.57■■■□□ 2.48
PTPRKQ15262 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
PTPRKQ15262 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
PTPRKQ15262 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.56■■■□□ 2.48
PTPRKQ15262 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC30.56■■■□□ 2.48
PTPRKQ15262 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
PTPRKQ15262 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC30.56■■■□□ 2.48
PTPRKQ15262 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
PTPRKQ15262 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
PTPRKQ15262 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC30.56■■■□□ 2.48
PTPRKQ15262 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
PTPRKQ15262 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC30.56■■■□□ 2.48
PTPRKQ15262 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
PTPRKQ15262 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
PTPRKQ15262 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.56■■■□□ 2.48
PTPRKQ15262 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC30.56■■■□□ 2.48
PTPRKQ15262 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
PTPRKQ15262 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC30.56■■■□□ 2.48
PTPRKQ15262 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.56■■■□□ 2.48
PTPRKQ15262 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
PTPRKQ15262 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC30.56■■■□□ 2.48
PTPRKQ15262 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
PTPRKQ15262 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
PTPRKQ15262 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
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