Protein–RNA interactions for Protein: Q15034

HERC3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC3, humanhuman

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Length 1,050 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3Q15034 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
HERC3Q15034 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
HERC3Q15034 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
HERC3Q15034 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
HERC3Q15034 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
HERC3Q15034 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
HERC3Q15034 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
HERC3Q15034 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
HERC3Q15034 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
HERC3Q15034 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC19.81■□□□□ 0.76
HERC3Q15034 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
HERC3Q15034 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
HERC3Q15034 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
HERC3Q15034 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
HERC3Q15034 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
HERC3Q15034 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
HERC3Q15034 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
HERC3Q15034 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
HERC3Q15034 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
HERC3Q15034 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
HERC3Q15034 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
HERC3Q15034 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
HERC3Q15034 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
HERC3Q15034 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
HERC3Q15034 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
HERC3Q15034 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
HERC3Q15034 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
HERC3Q15034 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
HERC3Q15034 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
HERC3Q15034 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
HERC3Q15034 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
HERC3Q15034 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
HERC3Q15034 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
HERC3Q15034 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
HERC3Q15034 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
HERC3Q15034 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
HERC3Q15034 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
HERC3Q15034 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
HERC3Q15034 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
HERC3Q15034 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
HERC3Q15034 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
HERC3Q15034 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
HERC3Q15034 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
HERC3Q15034 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
HERC3Q15034 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
HERC3Q15034 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
HERC3Q15034 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
HERC3Q15034 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
HERC3Q15034 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
HERC3Q15034 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
HERC3Q15034 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
HERC3Q15034 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
HERC3Q15034 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
HERC3Q15034 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
HERC3Q15034 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
HERC3Q15034 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
HERC3Q15034 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
HERC3Q15034 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
HERC3Q15034 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
HERC3Q15034 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
HERC3Q15034 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
HERC3Q15034 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
HERC3Q15034 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
HERC3Q15034 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
HERC3Q15034 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
HERC3Q15034 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC19.78■□□□□ 0.76
HERC3Q15034 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
HERC3Q15034 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
HERC3Q15034 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
HERC3Q15034 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
HERC3Q15034 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
HERC3Q15034 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
HERC3Q15034 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
HERC3Q15034 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
HERC3Q15034 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
HERC3Q15034 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
HERC3Q15034 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
HERC3Q15034 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
HERC3Q15034 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
HERC3Q15034 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
HERC3Q15034 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
HERC3Q15034 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
HERC3Q15034 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
HERC3Q15034 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
HERC3Q15034 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
HERC3Q15034 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
HERC3Q15034 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.75
HERC3Q15034 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
HERC3Q15034 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
HERC3Q15034 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
HERC3Q15034 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC19.76■□□□□ 0.75
HERC3Q15034 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
HERC3Q15034 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
HERC3Q15034 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
HERC3Q15034 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
HERC3Q15034 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
HERC3Q15034 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
HERC3Q15034 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
HERC3Q15034 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
HERC3Q15034 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
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