Protein–RNA interactions for Protein: Q149N8

SHPRH, E3 ubiquitin-protein ligase SHPRH, humanhuman

Predictions only

Length 1,683 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHPRHQ149N8 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
SHPRHQ149N8 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
SHPRHQ149N8 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
SHPRHQ149N8 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
SHPRHQ149N8 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
SHPRHQ149N8 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
SHPRHQ149N8 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
SHPRHQ149N8 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
SHPRHQ149N8 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC28.14■■■□□ 2.1
SHPRHQ149N8 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
SHPRHQ149N8 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
SHPRHQ149N8 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
SHPRHQ149N8 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
SHPRHQ149N8 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
SHPRHQ149N8 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
SHPRHQ149N8 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.14■■■□□ 2.09
SHPRHQ149N8 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SHPRHQ149N8 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SHPRHQ149N8 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SHPRHQ149N8 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SHPRHQ149N8 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SHPRHQ149N8 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SHPRHQ149N8 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SHPRHQ149N8 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SHPRHQ149N8 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
SHPRHQ149N8 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SHPRHQ149N8 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SHPRHQ149N8 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SHPRHQ149N8 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
SHPRHQ149N8 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SHPRHQ149N8 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SHPRHQ149N8 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SHPRHQ149N8 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SHPRHQ149N8 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SHPRHQ149N8 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SHPRHQ149N8 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
SHPRHQ149N8 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SHPRHQ149N8 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SHPRHQ149N8 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SHPRHQ149N8 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SHPRHQ149N8 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
SHPRHQ149N8 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
SHPRHQ149N8 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SHPRHQ149N8 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
SHPRHQ149N8 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SHPRHQ149N8 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
SHPRHQ149N8 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
SHPRHQ149N8 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
SHPRHQ149N8 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SHPRHQ149N8 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
SHPRHQ149N8 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
SHPRHQ149N8 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SHPRHQ149N8 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SHPRHQ149N8 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
SHPRHQ149N8 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SHPRHQ149N8 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SHPRHQ149N8 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SHPRHQ149N8 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SHPRHQ149N8 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SHPRHQ149N8 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SHPRHQ149N8 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SHPRHQ149N8 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SHPRHQ149N8 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SHPRHQ149N8 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SHPRHQ149N8 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SHPRHQ149N8 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SHPRHQ149N8 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SHPRHQ149N8 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
SHPRHQ149N8 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
SHPRHQ149N8 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SHPRHQ149N8 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SHPRHQ149N8 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SHPRHQ149N8 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SHPRHQ149N8 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SHPRHQ149N8 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SHPRHQ149N8 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SHPRHQ149N8 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SHPRHQ149N8 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SHPRHQ149N8 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SHPRHQ149N8 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SHPRHQ149N8 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SHPRHQ149N8 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SHPRHQ149N8 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SHPRHQ149N8 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SHPRHQ149N8 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SHPRHQ149N8 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SHPRHQ149N8 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SHPRHQ149N8 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SHPRHQ149N8 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SHPRHQ149N8 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SHPRHQ149N8 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SHPRHQ149N8 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SHPRHQ149N8 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SHPRHQ149N8 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SHPRHQ149N8 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SHPRHQ149N8 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SHPRHQ149N8 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SHPRHQ149N8 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SHPRHQ149N8 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
SHPRHQ149N8 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
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