Protein–RNA interactions for Protein: Q14973

SLC10A1, Sodium/bile acid cotransporter, humanhuman

Predictions only

Length 349 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC10A1Q14973 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
SLC10A1Q14973 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SLC10A1Q14973 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SLC10A1Q14973 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SLC10A1Q14973 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SLC10A1Q14973 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SLC10A1Q14973 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SLC10A1Q14973 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SLC10A1Q14973 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SLC10A1Q14973 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SLC10A1Q14973 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SLC10A1Q14973 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
SLC10A1Q14973 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC10A1Q14973 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC10A1Q14973 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC10A1Q14973 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC10A1Q14973 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC10A1Q14973 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC10A1Q14973 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC10A1Q14973 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC10A1Q14973 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC10A1Q14973 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC10A1Q14973 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC10A1Q14973 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC10A1Q14973 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC10A1Q14973 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC10A1Q14973 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC10A1Q14973 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC10A1Q14973 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC10A1Q14973 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC10A1Q14973 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC10A1Q14973 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC10A1Q14973 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC10A1Q14973 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC10A1Q14973 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC10A1Q14973 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC10A1Q14973 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC10A1Q14973 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC10A1Q14973 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC10A1Q14973 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC10A1Q14973 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC10A1Q14973 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC10A1Q14973 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC10A1Q14973 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC10A1Q14973 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC10A1Q14973 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC10A1Q14973 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC10A1Q14973 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC10A1Q14973 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC10A1Q14973 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC10A1Q14973 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC10A1Q14973 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC10A1Q14973 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC10A1Q14973 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC10A1Q14973 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC10A1Q14973 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC10A1Q14973 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC10A1Q14973 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC10A1Q14973 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC10A1Q14973 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC10A1Q14973 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC10A1Q14973 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC10A1Q14973 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC10A1Q14973 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC10A1Q14973 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC10A1Q14973 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC10A1Q14973 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC10A1Q14973 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC10A1Q14973 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC10A1Q14973 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC10A1Q14973 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC10A1Q14973 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC10A1Q14973 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC10A1Q14973 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC10A1Q14973 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC10A1Q14973 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC10A1Q14973 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC10A1Q14973 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC10A1Q14973 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC10A1Q14973 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC10A1Q14973 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC10A1Q14973 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC10A1Q14973 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC10A1Q14973 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC10A1Q14973 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SLC10A1Q14973 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SLC10A1Q14973 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SLC10A1Q14973 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SLC10A1Q14973 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SLC10A1Q14973 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SLC10A1Q14973 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SLC10A1Q14973 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SLC10A1Q14973 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SLC10A1Q14973 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SLC10A1Q14973 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SLC10A1Q14973 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SLC10A1Q14973 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SLC10A1Q14973 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
SLC10A1Q14973 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SLC10A1Q14973 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms