Protein–RNA interactions for Protein: Q14714

SSPN, Sarcospan, humanhuman

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Length 243 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSPNQ14714 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SSPNQ14714 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SSPNQ14714 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SSPNQ14714 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SSPNQ14714 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SSPNQ14714 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SSPNQ14714 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SSPNQ14714 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SSPNQ14714 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SSPNQ14714 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SSPNQ14714 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SSPNQ14714 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SSPNQ14714 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SSPNQ14714 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SSPNQ14714 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SSPNQ14714 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SSPNQ14714 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SSPNQ14714 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SSPNQ14714 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SSPNQ14714 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SSPNQ14714 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SSPNQ14714 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SSPNQ14714 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SSPNQ14714 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SSPNQ14714 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SSPNQ14714 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SSPNQ14714 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SSPNQ14714 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SSPNQ14714 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SSPNQ14714 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SSPNQ14714 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SSPNQ14714 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SSPNQ14714 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SSPNQ14714 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SSPNQ14714 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SSPNQ14714 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SSPNQ14714 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SSPNQ14714 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SSPNQ14714 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SSPNQ14714 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SSPNQ14714 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SSPNQ14714 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SSPNQ14714 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SSPNQ14714 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SSPNQ14714 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SSPNQ14714 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SSPNQ14714 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SSPNQ14714 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SSPNQ14714 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SSPNQ14714 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
SSPNQ14714 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SSPNQ14714 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SSPNQ14714 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SSPNQ14714 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SSPNQ14714 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SSPNQ14714 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SSPNQ14714 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SSPNQ14714 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SSPNQ14714 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SSPNQ14714 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SSPNQ14714 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SSPNQ14714 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SSPNQ14714 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SSPNQ14714 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SSPNQ14714 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SSPNQ14714 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SSPNQ14714 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SSPNQ14714 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SSPNQ14714 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SSPNQ14714 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SSPNQ14714 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SSPNQ14714 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
SSPNQ14714 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
SSPNQ14714 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SSPNQ14714 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SSPNQ14714 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SSPNQ14714 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
SSPNQ14714 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SSPNQ14714 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SSPNQ14714 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SSPNQ14714 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SSPNQ14714 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SSPNQ14714 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SSPNQ14714 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
SSPNQ14714 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
SSPNQ14714 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC18.77■□□□□ 0.59
SSPNQ14714 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
SSPNQ14714 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
SSPNQ14714 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
SSPNQ14714 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
SSPNQ14714 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
SSPNQ14714 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
SSPNQ14714 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SSPNQ14714 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SSPNQ14714 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SSPNQ14714 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SSPNQ14714 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SSPNQ14714 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SSPNQ14714 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SSPNQ14714 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
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