Protein–RNA interactions for Protein: Q14258

TRIM25, E3 ubiquitin/ISG15 ligase TRIM25, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 630 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM25Q14258 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRIM25Q14258 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRIM25Q14258 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRIM25Q14258 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRIM25Q14258 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRIM25Q14258 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRIM25Q14258 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRIM25Q14258 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRIM25Q14258 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRIM25Q14258 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRIM25Q14258 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRIM25Q14258 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRIM25Q14258 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRIM25Q14258 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRIM25Q14258 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRIM25Q14258 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRIM25Q14258 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRIM25Q14258 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRIM25Q14258 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRIM25Q14258 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRIM25Q14258 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRIM25Q14258 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRIM25Q14258 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRIM25Q14258 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRIM25Q14258 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRIM25Q14258 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRIM25Q14258 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRIM25Q14258 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRIM25Q14258 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRIM25Q14258 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRIM25Q14258 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRIM25Q14258 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRIM25Q14258 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRIM25Q14258 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRIM25Q14258 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRIM25Q14258 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRIM25Q14258 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRIM25Q14258 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRIM25Q14258 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRIM25Q14258 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRIM25Q14258 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRIM25Q14258 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRIM25Q14258 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRIM25Q14258 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRIM25Q14258 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRIM25Q14258 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRIM25Q14258 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRIM25Q14258 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRIM25Q14258 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TRIM25Q14258 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TRIM25Q14258 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TRIM25Q14258 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TRIM25Q14258 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TRIM25Q14258 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TRIM25Q14258 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TRIM25Q14258 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TRIM25Q14258 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TRIM25Q14258 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TRIM25Q14258 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TRIM25Q14258 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TRIM25Q14258 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TRIM25Q14258 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TRIM25Q14258 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TRIM25Q14258 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TRIM25Q14258 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TRIM25Q14258 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TRIM25Q14258 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TRIM25Q14258 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TRIM25Q14258 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TRIM25Q14258 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TRIM25Q14258 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TRIM25Q14258 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TRIM25Q14258 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TRIM25Q14258 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
TRIM25Q14258 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
TRIM25Q14258 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
TRIM25Q14258 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TRIM25Q14258 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TRIM25Q14258 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TRIM25Q14258 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
TRIM25Q14258 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TRIM25Q14258 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TRIM25Q14258 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TRIM25Q14258 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TRIM25Q14258 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TRIM25Q14258 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TRIM25Q14258 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TRIM25Q14258 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
TRIM25Q14258 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TRIM25Q14258 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TRIM25Q14258 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TRIM25Q14258 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TRIM25Q14258 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TRIM25Q14258 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TRIM25Q14258 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRIM25Q14258 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRIM25Q14258 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRIM25Q14258 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRIM25Q14258 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRIM25Q14258 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
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