Protein–RNA interactions for Protein: Q14162

SCARF1, Scavenger receptor class F member 1, humanhuman

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Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARF1Q14162 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SCARF1Q14162 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SCARF1Q14162 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
SCARF1Q14162 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SCARF1Q14162 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SCARF1Q14162 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SCARF1Q14162 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SCARF1Q14162 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SCARF1Q14162 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SCARF1Q14162 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SCARF1Q14162 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SCARF1Q14162 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SCARF1Q14162 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SCARF1Q14162 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SCARF1Q14162 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SCARF1Q14162 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SCARF1Q14162 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SCARF1Q14162 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SCARF1Q14162 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SCARF1Q14162 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SCARF1Q14162 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SCARF1Q14162 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SCARF1Q14162 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SCARF1Q14162 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SCARF1Q14162 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SCARF1Q14162 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SCARF1Q14162 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SCARF1Q14162 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SCARF1Q14162 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SCARF1Q14162 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SCARF1Q14162 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SCARF1Q14162 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SCARF1Q14162 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SCARF1Q14162 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SCARF1Q14162 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SCARF1Q14162 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SCARF1Q14162 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SCARF1Q14162 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SCARF1Q14162 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SCARF1Q14162 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
SCARF1Q14162 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SCARF1Q14162 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SCARF1Q14162 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SCARF1Q14162 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SCARF1Q14162 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SCARF1Q14162 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SCARF1Q14162 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SCARF1Q14162 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SCARF1Q14162 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SCARF1Q14162 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SCARF1Q14162 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SCARF1Q14162 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SCARF1Q14162 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SCARF1Q14162 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SCARF1Q14162 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SCARF1Q14162 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
SCARF1Q14162 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SCARF1Q14162 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SCARF1Q14162 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SCARF1Q14162 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SCARF1Q14162 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SCARF1Q14162 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SCARF1Q14162 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SCARF1Q14162 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SCARF1Q14162 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SCARF1Q14162 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SCARF1Q14162 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SCARF1Q14162 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SCARF1Q14162 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SCARF1Q14162 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SCARF1Q14162 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SCARF1Q14162 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SCARF1Q14162 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
SCARF1Q14162 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SCARF1Q14162 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
SCARF1Q14162 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SCARF1Q14162 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SCARF1Q14162 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SCARF1Q14162 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SCARF1Q14162 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SCARF1Q14162 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SCARF1Q14162 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SCARF1Q14162 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SCARF1Q14162 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SCARF1Q14162 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SCARF1Q14162 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SCARF1Q14162 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SCARF1Q14162 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SCARF1Q14162 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SCARF1Q14162 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SCARF1Q14162 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SCARF1Q14162 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SCARF1Q14162 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SCARF1Q14162 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SCARF1Q14162 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SCARF1Q14162 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SCARF1Q14162 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SCARF1Q14162 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SCARF1Q14162 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SCARF1Q14162 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
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