Protein–RNA interactions for Protein: Q14050

COL9A3, Collagen alpha-3(IX) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 684 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A3Q14050 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
COL9A3Q14050 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
COL9A3Q14050 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
COL9A3Q14050 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
COL9A3Q14050 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
COL9A3Q14050 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
COL9A3Q14050 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
COL9A3Q14050 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
COL9A3Q14050 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
COL9A3Q14050 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
COL9A3Q14050 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
COL9A3Q14050 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
COL9A3Q14050 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
COL9A3Q14050 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
COL9A3Q14050 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
COL9A3Q14050 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
COL9A3Q14050 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
COL9A3Q14050 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
COL9A3Q14050 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
COL9A3Q14050 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
COL9A3Q14050 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
COL9A3Q14050 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
COL9A3Q14050 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
COL9A3Q14050 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
COL9A3Q14050 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
COL9A3Q14050 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
COL9A3Q14050 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
COL9A3Q14050 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
COL9A3Q14050 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
COL9A3Q14050 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
COL9A3Q14050 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
COL9A3Q14050 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
COL9A3Q14050 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
COL9A3Q14050 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
COL9A3Q14050 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
COL9A3Q14050 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
COL9A3Q14050 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
COL9A3Q14050 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
COL9A3Q14050 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
COL9A3Q14050 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
COL9A3Q14050 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
COL9A3Q14050 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
COL9A3Q14050 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
COL9A3Q14050 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
COL9A3Q14050 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
COL9A3Q14050 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
COL9A3Q14050 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
COL9A3Q14050 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
COL9A3Q14050 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
COL9A3Q14050 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
COL9A3Q14050 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
COL9A3Q14050 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
COL9A3Q14050 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
COL9A3Q14050 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
COL9A3Q14050 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
COL9A3Q14050 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
COL9A3Q14050 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
COL9A3Q14050 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
COL9A3Q14050 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
COL9A3Q14050 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
COL9A3Q14050 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
COL9A3Q14050 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
COL9A3Q14050 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
COL9A3Q14050 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
COL9A3Q14050 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
COL9A3Q14050 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
COL9A3Q14050 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
COL9A3Q14050 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
COL9A3Q14050 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
COL9A3Q14050 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
COL9A3Q14050 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
COL9A3Q14050 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
COL9A3Q14050 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
COL9A3Q14050 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
COL9A3Q14050 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
COL9A3Q14050 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
COL9A3Q14050 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
COL9A3Q14050 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
COL9A3Q14050 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
COL9A3Q14050 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
COL9A3Q14050 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
COL9A3Q14050 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
COL9A3Q14050 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
COL9A3Q14050 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
COL9A3Q14050 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
COL9A3Q14050 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
COL9A3Q14050 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
COL9A3Q14050 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
COL9A3Q14050 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
COL9A3Q14050 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
COL9A3Q14050 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
COL9A3Q14050 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
COL9A3Q14050 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
COL9A3Q14050 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
COL9A3Q14050 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
COL9A3Q14050 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
COL9A3Q14050 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
COL9A3Q14050 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
COL9A3Q14050 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
COL9A3Q14050 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
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