Protein–RNA interactions for Protein: Q13950

RUNX2, Runt-related transcription factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 521 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX2Q13950 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RUNX2Q13950 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RUNX2Q13950 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RUNX2Q13950 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
RUNX2Q13950 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RUNX2Q13950 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RUNX2Q13950 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RUNX2Q13950 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RUNX2Q13950 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RUNX2Q13950 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RUNX2Q13950 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RUNX2Q13950 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RUNX2Q13950 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RUNX2Q13950 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RUNX2Q13950 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RUNX2Q13950 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RUNX2Q13950 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RUNX2Q13950 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RUNX2Q13950 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RUNX2Q13950 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RUNX2Q13950 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RUNX2Q13950 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RUNX2Q13950 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RUNX2Q13950 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RUNX2Q13950 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RUNX2Q13950 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RUNX2Q13950 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RUNX2Q13950 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RUNX2Q13950 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
RUNX2Q13950 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RUNX2Q13950 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RUNX2Q13950 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RUNX2Q13950 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RUNX2Q13950 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RUNX2Q13950 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
RUNX2Q13950 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RUNX2Q13950 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RUNX2Q13950 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RUNX2Q13950 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
RUNX2Q13950 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
RUNX2Q13950 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
RUNX2Q13950 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
RUNX2Q13950 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RUNX2Q13950 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RUNX2Q13950 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RUNX2Q13950 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RUNX2Q13950 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RUNX2Q13950 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RUNX2Q13950 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RUNX2Q13950 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RUNX2Q13950 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RUNX2Q13950 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
RUNX2Q13950 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RUNX2Q13950 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RUNX2Q13950 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RUNX2Q13950 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RUNX2Q13950 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RUNX2Q13950 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RUNX2Q13950 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RUNX2Q13950 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RUNX2Q13950 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RUNX2Q13950 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RUNX2Q13950 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RUNX2Q13950 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RUNX2Q13950 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RUNX2Q13950 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RUNX2Q13950 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RUNX2Q13950 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RUNX2Q13950 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RUNX2Q13950 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RUNX2Q13950 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RUNX2Q13950 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RUNX2Q13950 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RUNX2Q13950 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RUNX2Q13950 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RUNX2Q13950 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RUNX2Q13950 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RUNX2Q13950 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RUNX2Q13950 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RUNX2Q13950 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RUNX2Q13950 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RUNX2Q13950 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RUNX2Q13950 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RUNX2Q13950 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RUNX2Q13950 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RUNX2Q13950 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RUNX2Q13950 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RUNX2Q13950 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RUNX2Q13950 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RUNX2Q13950 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RUNX2Q13950 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RUNX2Q13950 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RUNX2Q13950 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RUNX2Q13950 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RUNX2Q13950 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
RUNX2Q13950 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RUNX2Q13950 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RUNX2Q13950 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RUNX2Q13950 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RUNX2Q13950 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
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